חיידקים ספר+מצגת קורס+וירוסים

Front 1

מהו Nucleiod?

Back 1

אזור מובחן בציטופלסמה בחיידקים ושם מצוי הכרומוזום שלו.

כמובן זה אזור לא גרעין והוא אינו ממדור בממברנה!

Front 2

לאיזה חיידקים יש דופן תא?

Back 2

גם לגראם חיובי וגם לגראם שלילי אם זאת הם נבדלים במבנה ופרמטרים אחרים.

Front 3

מהו תפקיד הקפסולה?וממה היא מורכבת?

Back 3

מעטפת polysaccharide מהווה גורם ווירולנטי ותפקדיה להגן על החיידק ממערכת החיסון.

סיוע בהדבקה למשטחים ועוד.

Front 4

מהו תהליך הCuring?

רמז קשור לפלסמיד

Back 4

כאשר פלסמיד אינו מהווה יתרון לחיידק הוא מכביד עליו לכן יש תהליך המכונה Curing וזה דחייה של הפלסמיד.

Front 5

ישנם כ-4 סוגי פלג'לות

הסבר כל אחת מהן

1. Monotrichous

2.Lophotrichous

3.Amhitrichous

4.Peritrichous

Back 5

1.Monotrichous-אחד ויחידה

2.Lophotrichous - צבר של פלג'לות בצד אחד של החיידק

3.Amhitrichous - שתי פלג'לות בשני קטבים מנוגדים.

4.Peritrichous - צברים של פלג'לות בכל מיני אזורים בחיידק

Front 6

לצביעת גראם יש 5 שלבים תמנה אותם.

Back 6

1.Fixation- חימום וייבוש מצע החיידקים על מנת לקבע אותך.

2.Crystal Violet - מתפרק ליון חיובי בשם CV וליון כלוריד שלילי. היון CV הוא בעל צבע סגול ומגיב למטענים השליליים שעל פני שטח החיידקים.

3. Iodine- מגיב עם CV ויוצר מבנים קריסטליים בתוך התא ומחוץ לו.

4.Decolorization- שימוש באלכוהל שמסיר את הצבע מחיידקי גראם שלילי.

5.Safranin- צובע את החיידקים הלא צבועים כלומר את גראם שלילי. בצבע אדום-וורד.

Front 7

תמנה את ההבדלים בין גראם חיובי ושלילי בתחומים הבאים:

לא ברמת המולקלות..

1.דופן

2. ממברנה

3. אזור ייחודי

4. מולקלות יחודיות

5. צבע בצביעת גראם.

Back 7

1. חיובי עבה במיוחד לעומת גראם שלילי שהיא דקה.

2. גראם חיובי דו שכבה יחידה בגראם שלילי כפולה (בינהם יש את הדופן התא)

3. גראם חיובי אין לגראם שלילי הפריפלזמה - האזור בין הממברנות בו מצוי דופן החיידק. ציטופלסמה ענייה בחלבונים.

4. בגראם חיובי יש Lipoteichoic Acid and Teichoic acid. ובגרם שלילי יש LPS

5. גראם חיובי בסגול גראם שלילי בוורוד\אדום

Front 8

איזה סוג קשרים אנו אמורים למצוא בדופן התא החיידק

ומה מפרק אותם ומה המונומרים שנמצאים שם?

Back 8

1. קשרי B-1,4

2. Lysozyme-(Muramidase-מפרק קשרים כאלו נמצא ברוק\עיניים.

3. NAG וNAM

NAM-GlcNAc -N-acetylglucosamine

NAM-MurNAc- N-acetylmuramic

Front 9

לאיזה מולקולה מתקשר באופן כימי קוולנטי הטטרה פפטיד?

ומה הוא דורש?

Back 9

מתבצע ל מולקלות ה-Nacetylmuramic או בקיצור NAM

התהליך אינו דורש ריבוזום אלא נעשה על ידי אנזימים.

Front 10

ממה מורכב ההטטרה פפטיד?

מה מוזר בה?

ואיך היא מחוברת אחת לשנייה בחיובי ובשלילי.

Back 10

L-alanine

D-glutamic acid

meso-diaminopimelic acid (נגזרת של Lysine)

D-alanine

קונפורמצית D לא נפוצה ולא אופיינית בתאים חיים.

מחוברת אחת לשנייה דרך קובצת ה-R כמו כן נמצא על הNAM.

מחוברת בגראם חיובי בpentaglycine bridge( בין ליזין לאלנין)

בגרם שלילי בין -meso Diaminopimelic acid (DAPA לאלנין. כמובן יש כמות מועטה

כמו כן DAPA היא נגזרת של Lys

והקישור מתבצע לקב' האמינו של DAPA אפסילון

Front 11

איזה אנזים עושה את פעולת הקישור המצליב בPeptidoglycan?

Back 11

אנזים הנקרא Transpeptidase

Front 12

תאר את סינטזת דופן התא

1. ציין את מקום ההתחלה.

2. את שם הטרנספורטר.

3.למי עם קשורים טרם הסינתזה (רמז קשר קוולנטי).

4. סוג הקשרים.

5. ואיזה חומצה אמינית יוצאת בתהליך?

Back 12

1. מתחיל בציטוזול ומועבר באופן אקטיבי לצד החוץ תאי.

2. נקרא Bactoprenol ליפיד חיידק שקשור את NAM ואת NAG.

3. טרם הסינתזה קשורים קוולנטית לUDP מאפשר לאקטב אותם במטרה ליצירת קשר גליקוזידי.

4.לא בהכרח קשרים פפטידים אלא מוערבים גם שייר R.

5. נוצר פנטה פפטיד ותוך כדי הסינתוז על ידי Tran peptidase (נקרא גם PBP-penicillin binding protein)

שעושה cross-linking עפה החומצה האמינית Ala כתוצר לוואי.

Front 13

מהי המערכת ABC

ATP binding Cassette

Back 13

מערכת הפרשה\הכנסה חיידקית של חומרים שונים

עושה שימוש בATP

כמו כן חשוב לציין שיש אותה גם לבקטריה,ארכאה ויוקרייה.

Front 14

לחיידקי גראם שליליים יש מערכת הפרשה שנקראת TOSS1

תאר את דרך פעילות.

Back 14

זהו מערכת הפרשה התלויה במפעילות של צ'פרון שסמוך למערכת ABC, כך שמתאפשר העברה אקטיבית מבעד לשתי הממברנות.

ואז מערכת מסוג 2 מאפשרת העברה של מגוון גדלים של מולקולות מיונים ועד חלבונים.

Front 15

תאר את מערכת מסוג T2SS 2

ישנם כ-2 שלבים.

Back 15

שלב ראשון - העברה לפריפלזמה על ידי קומפלקסים המכונים Sec או Tat.

השלב השני - הוא העברה מהפריפלזמה החוצה על ידי מערכת הפרשה מסוג 2.

Front 16

פרט על מערכת הפרשה מסוג T3SS3 של חיידקי גראם שלילי.

(נקראת גם Injectisome)

Back 16

מערכת חשובה במיוחד שחיידקי גראם שלילי נצמדים לתא אחר ומזריקים לו חומר. יש למערכת מבנה תלוי סיכה. תהליך ההזרקה תלוי בATP וריכוז סידן נמוך בציטופלסמה.

אין צורך לזכור את השמות בתמונה זה רק להמחשה.

לדעת שמורכב ממחט וגוף באזלי שעשוי טבעות המזכירות את הטבעות של הפלאג'לה הפרוקריוטית של גרם שלילי.

Front 17

מערכת הפרשה מסוג 4

עוד לא עברנו עליה בשיעור

Back 17

מנגנון הדומה לתהליך הקוניוגציה.

החיידקים יכולים להעביר חלבונים וDNA.

Front 18

פרט על האנטיביוטיקה הבאה: Beta-Lactams

את הפרמטרים הבאים.

1.מטרה

2.המגנון

3.דוגמא

4.טוב עבור (שלילי\חיובי).

Back 18

1. דופן החיידק

2.עיכוב Cross-linking

3.פנצילין.

4.גראם חיובי

הנפוצה ביותר משפחה גדולה שכוללת בתוכה עוד משפחות.

Front 19

פרט על האנטיביוטיקה הבאה: Glycopeptides

את הפרמטרים הבאים.

1.מטרה

2.המנגנון

3.דוגמא

4.טוב עבור (שלילי\חיובי).

Back 19

1. דופן החיידק

2. קשירת פרקורסור של הפפטידוגליקן

3. Vancomycin

4. גראם חיובי

Front 20

פרט על האנטיביוטיקה הבאה: Aminoglycosides

את הפרמטרים הבאים.

1.מטרה

2.המנגנון

3.דוגמא

4.טוב עבור (שלילי\חיובי).

Back 20

1.סינתזת חלבונים

2. עיכוב של תת היחידה 30S

3.Kanamycin, Gentamtcin

4.גראם חיובי ובעיקר גראם שלילי

Front 21

פרט על האנטיביוטיקה הבאה: Macrolides

את הפרמטרים הבאים.

1.מטרה

2.המנגנון

3.דוגמא

4.טוב עבור (שלילי\חיובי).

Back 21

1. סינתזת חלבונים

2. עיכוב של תת היחידה 50S.

3. Erythromycin
4.גראם חיובי ושלילי.

Front 22

פרט על האנטיביוטיקה הבאה: Oxazolidinones

את הפרמטרים הבאים.

1.מטרה

2.המנגנון

3.דוגמא

4.טוב עבור (שלילי\חיובי).

Back 22

1. סינתזת חלבונים

2. עיכוב אניציאציה של תרגום

3. Linox

4. בעיקר גראם חיובי עמידים אבל גם גראם שליליים.

Front 23

פרט על האנטיביוטיקה הבאה: Quinolone

את הפרמטרים הבאים.

1.מטרה

2.המנגנון

3.דוגמא

4.טוב עבור (שלילי\חיובי).

Back 23

1. רפליקצית DNA

2. עיכוב טופואיזומראזות (DNA Gyrase etc)

3. Ozex

4.גרם חיובי עמידים וגראם שלילי

Front 24

פרט על האנטיביוטיקה הבאה: Polymyxin

את הפרמטרים הבאים.

1.מטרה

2.המנגנון

3.דוגמא

4.טוב עבור (שלילי\חיובי).

Back 24

1. פגיעה בממברנה.

2. חירור ופגיעה ביציבות הממברנה

3. Colistin

4. גראם שלילי

בעייתי כי פוגעת גם בנו

Front 25

פרט על האנטיביוטיקה הבאה: Metabolism inhibitors

את הפרמטר הבא

1.מטרה

Back 25

1. פגיעה ביצירת חומצה פולית

Front 26

פרט על כל אחד מExotoxins הבאים.

1.Superantigens

2.Hemolysin

3. Shina toxin

Back 26

1.Superantigens - גורמים לאקטיבציה חזקה של תאי T כאשר יותר מ20% תאי T מופעלים יכול לגרום לToxic Shock Syndrome ולקריסת מערכות

2.Hemolysin - גורם לחירור הממברנה בכדוריות דם האדומות ולמוות בתאים.

3. Shina toxin - גורם לביקוע של 28s rRNA של תת היחידה 60s כמובן בתא היוקריוטי וכך מעכב סינתזת חלבונים.

Front 27

פרט על כל אחד מה-Endotoxins הבאים

1. Diphteria Toxin

2. Cholera Toxin

3. Tetanus Toxin

Back 27

1. Diphteria Toxin - גורם לריבוזילציה ADP Ribosylation (טבעת Nicotinamide יוצאת ) של פקטור האלונגציה eEF2

2. Cholera Toxin - גורם לריבוזילציה (ADP Ribosylation) של האנזים אדנילאט ציקלאז. דבר המגביר את פעילותו ובכך גורם להצטברות נוזלים ויונים במעי ולשלשול.

3. Tetanus Toxin - פוגע במערכת העצבים המרכזית

Front 28

ADP-Ribosylation

מה זה

Back 28

לחפש את המנגנון

ADP-ribose isderived from nicotinamide adenine dinucleotide (NAD)

Front 29

ישנם כ-4 סוגי מצעי גידול פרט על כל אחד מהם.

1.Rich culture medium

2.Differential medium

3. Selective medium

4. Enrichment medium

Back 29

1.Rich culture medium - גורם לשגשוג של מרבית החיידקים הניתנים לגידול במעבדה.

2.Differential medium - מצע שנצבע בצבע מסויים כאשר סוג מסויים של חיידק גדל בו או חיידק בעל תכונה מסויימת.

3. Selective medium- מאפשר גדילה של חיידקים מסויימים.(למשל רק כאלה שרכשו פלסמיד וכו')

4. Enrichment medium - מצע סלקיטיבי שמאפשר שגשוג של קבוצת חיידקים שבדרך כלל מינורית באוכלוסיית החיידקים הנהדרת.

Front 30

פרט על הסוגי הספירות של חיידקים

1.Direct viable count\ Live count

2. O.D \ in direct turbidity

כמובן תתייחס ליתרונות וחסרונות

Back 30

1. מהילה של החיידקים במהיול עשרוני. ניתן להבחין בין תאים חיים למתים מושבות שמתחת ל10 או מעל 200 לא אמינות בספר רשום לקחת בין 10-50 מושבות. כמובן אנו מניחים שכל מושבה היא בחיידק בודד. כמו כן יש להכפיל על מנת לקבל את מספר החיידקים הראשוני.

2. מהיר , לא צריך לעצור את הניסוי, חיסרון לא ניתן להבדיל בין חיידקים חיים למתים.(למרות שיש מקרים שכן שהחיידק עובר ליזיס כאשר הוא מת).

Front 31

1.מה הסדר גודל של חיידקים?

2.מה הסדר גודל של וירוסים?

Back 31

1. חיידקים 1-10 מיקרומטר

2. ווירוסים 10-100 ננומטר. (ניתן לראות רק עם מיקרוסקופ אלקטרוני)

Front 32

מהו תפקיד הקפסולה Capsule?

Back 32

התנגדות לפעלות פאגוציטוזה

והיצמדות למשטחים (אדהזיה)

Front 33

מה תפקיד של דופן התא (Cell Wall)?

Back 33

צורה , התנגדות לכוחות אוסמוטיים

Front 34

מה תפקיד הFimbriae?

Back 34

היצמדות וזיווג הגון.

Front 35

מהו תפקיד הInclusion body?

Back 35

מאגרים של פחמן פוספט וכו'.

Front 36

דרך איזה חלק בFlagella זורם פרוטונים?

ואיך נוצר הגרדיאנט?

Back 36

דרך הStator.

והגרדיאנט נוצר על ידי ATP.

Front 37

יש שתי תנועות של החיידק, לאיזה כיוון צריכה לנוע הפלג'לה על מנת ליצור את התנועות הבאות.

1. Smooth and specific?

2.Tumbling?

Back 37

1. counter clockwise

2.clockwise

Front 38

תאר את המנגנון הביוכימי של מערכת הTwo component system של הפלג'לה.

התייחס בתושבתך ל-

1. רצפטור

2.CheW

3.CheA

4.CheY

5.CheZ

לזירחון ומתילציה.

Back 38

1.הרצפטור מרגיש repellent or attractant.

2. לאחר מכן CheW הוא חלבון אדפטור ומעביר את המסר.

3. CheA מזרחן את עצמו על היסטדין (נדיר). ומעביר את הפוספט

4.לCheY שהוא יכול ליצור תנועה יחד עם הפלג'לה.

5. עוזר להוריד את הפסופט (אפשר גם בלעדיו) .

פחות זירחון יותר תנועה מסוג smooth.

מתילציה גורמת לדה סנסטיזציה (מוריד את הפעילות לפרק זמן מסויים).

משפיעה גם שיש repellent וגם שיש Attractant.

Front 39

איך נקרא מבנה הפלג'לה אצל יוקירוטים?

לבדוק אם זה רק שלהם.

Back 39

axoneme מורכב ממבנה של מיקרוטובלים שנקרא 9+2.

יש שני subfiber a\b

B מחבק את A.

יש עוגן של הפלג'לה - 9 שלשלות של מיקרוטבולי.

Front 40

1.מהם התכונות של Teichoic acid?

2.ושל Lipoteichoic acid?

Back 40

1.מאוד אנטיגנית, בעלת מבנה שלילי לכן י

לה לאסוף קטיונים(חיובי), קשורה באופן קוולנטי לפפטידוגליקן.

2. מולקולה amphipatic כמו הראשונה. אנטיגנית , ציטוגנית ואדהזיה.

Front 41

מהם האזורים של LPS -Lipopolysaccharides?

יש 3

Back 41

1. Lipid A- זה העוגן שלה לממברנה.

2. Core polysacchride- גשר כזה שמחבר בין העוגן לחלק החשוב.

3. O antigen- החלק המציץ שפוגש את מערכת החיסון

Front 42

על איזה חיידקים צביעת גראם לא תעבוד.

Back 42

1. Gram Variable
2. Gram- indeterminate

Front 43

מה זה Braun's lipoprotein

ואיפה עשויים למצוא אותו?

Back 43

עשויים למצוא אותו בגראם שלילי.

הוא מחבר בין הממברנה החיצונית בצורה לא קוולנטית

לפפטידוגליקן בצורה קוולנטית.

Front 44

למה המילה Spheroplast מתייחסת?

Back 44

חיידק בלי דופן תא

בלי cell wall.

ולכן חשוף לכוחות אוסמוטיים

Front 45

איפה מתבצע הפירוק והבנייה (בפנים או בחוץ) של הcell wall ובאיזה מצב זה נמצא?

Back 45

הפירוק בחוץ והבנייה בפנים

כאשר המצב תקין זה בשו"מ אלא אם כן יש משהו שהפריע ^^. למשל אנטיביוטיקה.

Front 46

מה דוחס את הגנום אצל פרוקריוטים?

Back 46

Polyamines with magnesium ions

Front 47

למה משמש החלבון FtsZ

ומה יקרה כאשר יהיה בו מוטציה?

Back 47

חלבון זה יוצר את הספטום קשור לטובולינים ומגייס חלבונים רבים וגורם לחלקות התא הבינארי.

כאשר יהיה פגיעה נקבל 2 תאים אך מחוברים.

Front 48

למה מתייחס המושג וירון?

Back 48

זה הוירוס השלם שכולל סוג אחד של חומצת גרעין

DNA or RNA וCapsid

Front 49

מה זה Capsid ואיזה מטען יש לו?

Back 49

זוהי המעטפת שמגנה על הוירוס

ויש לו מטען חיובי כך שממסך על המטען השלילי של הDNA

Front 50

מהו התתי יחידה של הcapsid shell?

איזה סוגים יש והאם התהליך דורש אנרגיה?

Back 50

Protomers התת יחידה

התהליך אינו דורש אנרגיה ונקרא Self assembly

כמו כן יש שני מבנים

Helical symmetry - היחידות מאורגנות כהליקס

Icosahedral symmetry- מתארגן למבנה סימטרי

Front 51

איזה תכונות יש למבנה של Helical Symmetry?

Back 51

מערך ספיראליצורה גם קשיחה וגם גמישה והוא מוארך.ואפשר לזהות ככה וירוסים.אפשר לאפיין לפי שיפוע, רוחב , אורך מספר הפרומוטרים וכדומה.

Front 52

איזה תכונות יש למבנה של Icosahedral symmetry- ?

Back 52

יש לו 20 פאות יש לו מבנה תלת מימדי. התת יחידה נקראת Capsomeres והיא מורכבת מ5 או 6 protomers.

הזיהוי של הוירוסים נעשה על ידי מספר הcapsomere והדפוס שלהם.

Front 53

לעיתים הוירוס עטף בממברנה שנקראת viral envelope מאיפה הוא השיג אותה ואיזה חומרים יש עליה.

Back 53

ממברנה זה היא ממברנת בילייר של התא שהוא התקיף אותו בדרך כלל הממברנה הפלסמה. אפשרי גם מהגולג'י ומהER.

על הממברנה יש לו חלבונים שנקראים Peplomers(Spikes.

הם חיונים לחיבור של הויריון עם התא המארח.

Front 54

מה יכול לגרום מוטציה במסגרות הקריאה של הוירוס?

Back 54

הוירוס מנצל את 3 מסגרות הקריאה לכן מוטציה אחת יכולה להשפיע על 3 גנים שונים.

Front 55

Positive ssRNA virus

הרחב עליו

Back 55

1.Replicase, aRNA-dependent RNA polymerases, polymerizes minus ssRNAon a plus ssRNA

2.Transcriptase, a RNA-dependent RNA polymerases, polymerizes plus ssRNA(mRNA) on a minus ssRNA.77

Front 56

Negative ssRNA virus

הרחב עליו ומה הוא חייב להביא איתו

Back 56

חייב להביא איתו רפליקאז משל עצמו. ואז מקבלים RNA פלוס מהRNA מינוס.

הRNA פלוס יכול תרגום על ידי ריבוזומים של המארח.

Front 57

מה מיוחד בdsRNA Virus?

Back 57

dsRNA הוא לא דבר שקיים בתאים רגילים לכן הוא מדליק את מערכת החיסון. לכן בנוסף RNA dependet RNA polymerase שוירוס זה מביא איתו.(כי אי אפשר לתרגם את הפלוס כי הוא מצומד למינוס)

הוא מביא איתו גם Subviral particle שמגן על הRNA.

הוריוס נכנס לתא ואז הוא מתפרק לסינגל סטרנד.

הפלוס משמש לסינזתה של המינוס ואז הdsRNA מיוצר מחדש.

Front 58

מהם המרכיבים של Retrovirus?

Back 58

1.שתי מולקלות sene ssRNA זהו שקשורות לא קוולנטית!.

2.שתי envelope proteins.

3. 3 חלבונים פונקציונלים לא מבניים!.

א. Reverse Transcriptase RT

ב. Integrase IN

ג. Protease PR

Front 59

מה עושה RNA -depndent DNA polymerase?

Back 59

הופך RNA ל-גדיל של DNA.

Front 60

תאר את דרך פעילותו של RT

(Reverse Transcriptase)

Back 60

1.First, RT uses the +RNA as a template to form a RNA-DNA hybrid. Then the RibonucleaseH (RNaseH)component of RT degrades the +RNA strand to leave -DNA.

2.Second, RT uses the newly made -DNA as a template to produce a dsDNA called proviral DNA that is integrated into the host cell genome by viral Integrase

Front 61

בהדבקה פאג'ת יש שלושה תקופת פרט על כל אחת מהן.

1. Eclipse Period

2. Latent Period

3. Lytic(rise) Period

4. ** Burst size

Back 61

1. Eclipse Period - הזמן מההדבקה עד להופעה של פאג'\וירוס בוגר.

2. Latent Period - הזמן מההדבקה עד שיש הופעה של צאצאים מחוץ לתא.

3. Lytic(rise) Period - הזמן מסוף הlatent period עד שכל הפאג'ם מחוץ לתא.

4. **

Burst size- מספר הפאג'ים ששוחררו על ידי המארח במחזור החיים ליטי.

Front 62

הפאג'ם מחולקים לשתי קבוצות עיקריות תאר כל אחת מהן.

1.Temperate phages
2. Virulent Viruses

Back 62

1.Temperate phages- מדביקים את הבקטריה אך לא עושים ליזיס נקרא המסלול הליזוגני (Lysogenic)

2. Virulent Viruses- עושים ליזס לתא לאחר ההדבקה נקרא המסלול הLytic

Front 63

יש שתי גנים בפאג' שאחרים על בחירת המסלול הליטי או הליזוגני ציין אתם ואת סדר הקשירה שצריך להיות להם.

Back 63

Front 64

Transformation

Transfection

Conjugation

Transduction

Nitrogen Fixation

Neurobiology

Basic structure of neuron

Resting potential & action potentialGliacellsPentose phosphate pathway

Vesicular Transport

Cellular Junctions

Back 64

ש.ב לעשות