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43 Cards in this Set
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Que es un peptido |
Es un polímero de aminoácidos unidos por enlaces amida entre el grupo amino de cada aminoácido y el grupo carboxilo del aminoácido vecino. El enlace amida se denomina enlace peptídico c=o - n - H |
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Nomenclatura |
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Protomero |
Unidad repetida de una o más subunidades proteicas asociadas de manera estable en una estructura proteica mayor |
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Masa molecular de un aminoácido |
Aproximadamente de 128 a Dalton en una cadena de aminoácidos es de 110 Dalton |
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Funciones de las proteínas |
Estructura colágeno histonas Catálisis polimerasa de ADN pepsina y lisocina movimiento miosina Regulación y señalización, factor de la descripción inmunogamma globulina insulina Transporte canal de potasio mioglobina albumina |
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Interacciones químicas que estabilizan a las proteínas |
Enlace iónico enlace disulfuro enlace covalente enlace hidrógeno fuerzas de vanderwaal |
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Estructura las proteínas |
Estructura primaria cadena de aminoácidos proceso ensamblaje estructura secundaria hélices Alfa y láminas plisada/plegadas (pleated sheet) proceso plegamiento(Cada grupo carbonilo peptídico se une mediante un enlace a hidrógeno a un grupo hnc de la siguiente vuelta de la hélice(hélice Alfa) / de la cadena peptídica adyacente) N-c--o--------h-nc.... estructura terciaria hélices Alfa y láminas plegadas empaquetamiento estructura cuaternaria proceso interacción |
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Hélices |
3/10 3.6/13(alfa) 4.4/16(pi) |
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Que es diálisis |
3 diálisis separa a las moléculas de esta disolución a través de sus diferencias en el índice de difusión a través de una membrana semipermeable |
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Cómo se realiza una secuenciación de proteínas |
Se desnaturaliza la proteína la fragmentación y separación de péptidos mediante electroforesis transferencia a una membrana y extracción extraemos la proteína y le agregamos el reactivo de Edwin Qué es isocianato de metilo el cual se pega en la terminal n de la cadena y usando hplc se puede detectar fácilmente |
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Cromatografía de afinidad y de intercambio iónico |
Método de separación físico con una columna cromatográfica el analito es el que estamos buscando. Separa las moléculas por su tamaño según su dimensión las moléculas más grandes son las que salen primero porque las pequeñas entran en un medio poroso Fase estacionaria y fase móvil estacionaria no se mueve por la membrana móvil se mueve las partículas hacia abajo
En la cromatografía de intercambio iónico la matriz está cargada positiva o negativamente de acuerdo a las proteínas que queremos separar o con el cambio de pH del solvente y la separa por su fuerza de Unión |
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Cromatografía de alta afinidad hplc |
En la bomba hay jeringas e inyectadores que lo llevan a unas columnas para separar a las moléculas lo lleva unos detectores que ahí está su importancia pues pueden ser de muchas cosas y como radiación ultravioleta y luego al software o integrador |
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Electrofores bidimensional de isoelectroenfoque |
La diferencia está en los tubos de preparación de la muestra separados por su punto isoeléctrico los cuales se meten a una electroforesis sds le meten carga y así se paran a las proteínas de acuerdo a su punto isoeléctrico y su tamaño |
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Que son los priones |
Proteínas mal plegadas y que hace que más proteínas se hagan igual de mal plegadas prpc más estudiada |
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Otros nombres de los carbohidratos |
Hidratos de carbono glucósidos sacáridos polihidroxialdeido o cetonas.
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Importancia de los carbohidratos |
Almacenan energía fuente de carbono formal tejidos Formados por enlaces éter Son los más abundantes de la Tierra formados por glucosa |
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Clasificación de carbohidratos |
Triosas tetrozas pentosas hexosas heptosas aldosas aldehído cetosas cetonas. los monosacáridos no se hidrolizan y son conglomeraciones de carbohidratos los ósidos están divididos a su vez en holócidos compuestos exclusivamente de monosacáridos y heterocidos que contienen otros componentes |
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Nomenclatura |
Primero Se pone el término Aldo para aldeido (H-C--o) y seto para cetona (c--o) y después el término de acuerdo a la cantidad de carbonos que presentan por ejemplo hexosa aldoexosa es la glucosa cetohexosa es la fructosa |
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Características de monosacáridos |
Cristalinas o blancos solubles en agua sabor dulce azúcares reductores |
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Esterizomería de los monosacáridos Isómeros de configuración |
Enantiómeros imágenes especulares uno del otro como una x el carbóno más alejado del aldeido es el que determina la asignación d /l de si su carbono está unido a Oh =D, y al H =L
Diasteromeros = no son imágenes especulares uno del otro hay dos o H de un lado o un hidrógeno y un Oh Anomeros= se diferencian de la conformación del Carbón anomérico el carbón que une a los cíclicos de al menos cinco
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Cómo se hacen los carbono anomérico |
Es el número cuatro el tercero de abajo hacia arriba el carbono 5 arriba y carbono 3 abajo seguido del 2 del 1 y del oxígeno, los Oh que estaban a la derecha se ponen abajo del plano y los que estaban a la izquierda se ponen arriba, el carbono 6 arriba del carbono 5 |
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Isómeros conformacionales ( Misma configuración estereoquímica pero diferente conformación tridimensional) |
Azúcares fosfato. Unidos a un grupo fosfato por enlace Éter h-o-p--o aminoázucares. El grupo hidroxilo 2 está sustituida por una amina nh2 azúcares alcoholes reducción del grupo carbonilo en un hidroxilo ch2-oh azúcares ácidos se obtienen mediante la oxidación de algún carbono si es el carbonílico se obtiene ácido aldómico si es carbono hidroxílico se obtiene ácido úronico ( se abre el ciclo desde el oxígeno no el que es doble enlace sino el que forma la figura y ahora se forma 2 Oh) desoxi azúcares. Algunos de sus grupos hidróxidos oh pasa a H más importante es desoxirribosa parte de la ADN Glucósidos, en el hidróxido de carbono anomérico le meten agua y salen compuesto denominado o glucósidos h-oh+ch3oh = h-o-ch3 +H2O Enlace glucosidico h-o-h entre carbono 1 y carbono anomérico (4) h-o-h entre carbono 1 y carbono anomérico (4) |
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Oligosacarido |
Más de res monosacáridos Sabor dulce solubles en agua la mayoría de ellos conserva el poder reductor exosas unidas por un enlace éter con un carbono carbonílico oh libre en sus extremos 4 |
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Polisacáridos |
La mayoría de glúcidos naturales se encuentra en forma de polisacáridos se diferencian como heteropolisacáridos y homopolisacáridos. Homópolisacáridos está el almidón glucógeno celulosa quitina y heteropolisacáridos son péptidoglicano y el agar |
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Qué son los lípidos y cuáles son sus funciones |
Son moléculas no solubles en agua reunidas ( poco polares. ) almacenan energía aceite y grasas confactores de encima no forman polímeros son derivados hidrocarbonados con un nivel de oxidación bajo Tienen una cabeza polar y una no polar los lípidos de almacenamiento como las grasas de aceite son de 4 a 36 carbonos y el grupo carboxílico es el que tiene la cabeza hidrofílica O sea la cabeza polar la que sí se disuelve con agua |
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Tipos de lípidos |
Saturados un enlace. ( líneal) infaturados dos enlaces. Insaturados cis (en forma de C y los hidrógenos Del mismo lado) trans (trans líneal hidrógeno de un lado hidrógeno del otro) |
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Nomenclatura |
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Fosfolípidos repaso |
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Qué es un nucleósido nucleotido ácido nucleico |
Azúcar = pentosa base nitrogenada = purinas _ adenina guanina pirimidinas_ Citosina timina y uracilo (AT/U GC) Enlace fosfodiester
Oh O=P oh Oh La importancia de los nucleótidos cae en las coenzimas como nabp y transportador de energía como ATP |
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En qué se diferencia el ARN y el ADN |
En la pentosa que tienen ADN desoxirribosa (H) ARN ribosa(OH) Y por sus bases nitrogenadas Purinas (2 anillos) guanina adenina Pirimidinas (1 anillo) citosina timina (ADN) uracilo (ARN)
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Cuáles son las dos hipótesis de catálisis enzimática |
1894 Emily Fisher propuso la hipótesis de la cerradura en la llave la enzima acomoda el sustrato específico de la misma manera que la cerradura lo hace con la llave específica. 1958 Daniel koshland propuso la hipótesis de ajuste inducido en la que la enzima no acepta simplemente al sustrato sino que también exige al sustrato que se distorsionen a algo cercano al Estado de transición |
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Bases nitrogenadas |
purinas _ adenina guanina con 2 ( un hexágono y un pentágono) se diferencia la guanina porque en el carbono 6 del hexágono está unido a un doble enlace con oxígeno y la adenina con una amina nhh
pirimidinas_ Citosina timina y uracilo ( un hexágono) se diferencia el uracilo porque en el carbono 5 tiene un hidrógeno y en el carbono 4 un doble enlace oxígeno la citosina también tiene el carbono 5 con hidrógeno pero en el carbono 4 tiene una amina nh y la timina También tienen el carbono 4 con doble enlace oxígeno pero en el carbono 5 tiene un carbono con tres hidrógenos) |
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Estructura secundarias del ADN |
Horquillas y cruces ARN de una sola cadena Triples hélices de ADN estructura g4 cuádriceps de ADN relacionado con el cáncer por el plomero |
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Qué es el centro activo |
También se le dice lugar activo es la región de la enzima donde se une a la molécula de sustrato tiene tres funciones uno une al sustrato reduce la energía del estado de transición impulsa directamente el acontecimiento catalítico es pequeño y tridimensional tiene interacciones no covalentes y es una cavidad formada por restos de aminoácidos |
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Qué son las proteasas |
rompen enlaces peptídicos serina histidina aspartato la triada catalítica |
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Estrategias de catálisis |
Por aproximación dos sustratos cercanos (la enzima junta los sustratos para que ellos se agarren) covalente por un nucleófilo que cede electrones y es temporalmente covalente (la enzima agarra el sustrato) (nuclefilicos 3 proteasas aspartato) ácido base una molécula diferente al agua es aceptor o donador de protones. iones metálicos cargas negativas microelementos cofactor) |
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Nomenclatura de las encimas |
Uno óxido reductasas dos transferasas tres hidrolasas cuatro liasas cinco isomerasas seis ligasas |
1o 2t 3h 4l 5i 6l |
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Qué son las holoenzimas |
Es una apoenzima no activa más un cofactor una coenzima y la oloensima si está activa |
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Qué es un cofactor |
Las enzimas no son buenas catalizadores en reacciones reducción y transferencia de grupos por eso necesitan cofactores los cofactores son lugares no proteicos se diferencian del grupo prostético porque el grupo prostético tiene un enlace covalente y los cofactores un enlace débil hay de naturaleza inorgánica como los microelementos y de naturaleza orgánica como las coenzimas sus funciones es que altera la estructura tridimensional de la proteína interviene en la reacción como sustrato y es donador o aceptor de un grupo químico |
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Envío energética Cuáles son los tipos de sistemas |
El sistema es donde se lleva a cabo el proceso entorno lo de afuera del sistema universo sistema más entorno aislado. Aislado no energía no materia cerraron si energía no materia abierto sin energía sin materia célula |
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Cuáles son las variables energéticas |
Energía INTERNA U = q-W calor menos trabajo) ENTALPÍA H=U+W ( energía interna más trabajo obligatorio) ( calor liberado o absorbido) (proceso endotérmico obtiene energía entalpia es mayor proceso exotérmico libera energía entalpia es menor) entropía S grado de desorden Energía libre de GIBBS G = H-TS. ( entalpía menos temperatura por entropía) cuando g menor a cero es espontáneo exergónico sin energía G mayor acero no es espontáneo y es endergonico necesita energía cuando es igual a cero está en equilibrio todas son variables extensivas es decir que dependen de la cantidad de la materia con las últimas dos predecimos si un proceso es espontáneo es decir que no requiere energía para llevarse a cabo |
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Solubilidad de los lípidos |
Poca solubilidad (Cadena hidrocarbonada apolar). Cuanto más larga sea la cadena acíclica grasa y menor el número de insaturaciones, menor es la solubilidad |
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Triacilgliceroles: Grasas /acilgliceros grasas neutras / trigloceridos, lo mismo |
son triésteresde ácidos grasos y glicerol. Los triacilgliceridos están compuestos de tres ácidos grasos unidos por un enlace éster con un solo glicerol Constituyen la principal forma de almacenamiento de energía de muchos organismos |
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