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25 Cards in this Set
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ADN |
Se trouve dans le noyau et certains organites dans les eucaryotes Se trouve dans le cytoplasme chez les procaryotes Généralement double brin Porte l'information nécessaire à la synthèse des protéines et à sa régulation Sucre : désoxyribose Nucléotides : dAMP, dTMP, dCMP, dGMP |
Acide DésoxyriboNucléique |
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ARN |
Simple brin sauf dans certains virus Sont de plusieurs types Permettent exécution de la synthèse protéique Certains régulent l'expression des gènes Sucre : ribose Nucléotides : AMP, GMP, UMP, CMP |
Acide RiboNucléique |
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Base pyrimidique (noyau pyrimidine : 2N en position 1 et 3 + cétone sur C2) Porte une fonction amine sur C4 Complémentaire à G |
Cytosine |
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Base pyrimidique (noyau pyrimidine : 2N en position 1 et 3 + cétone sur C2) Porte fonction cétone sur C4 Porte fonction méthyle sur C5 Spécifique de l'ADN Complémentaire à A |
Thymine |
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Base pyrimidique (noyau pyrimidine : 2N en position 1 et 3 + cétone sur C2) Porte une fonction cétone sur C4 Spécifique de l'ARN Complémentaire à A |
Uracile |
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Base purique (noyau pyrimidine accolé à un imidazole, 2N en position 7 et 9) Porte une fonction amine sur C6 Seule base azotée de contenant pas de O Complémentaire à T et U |
Adénine |
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Base purique (noyau pyrimidine accolé à un imidazole, 2N en position 7 et 9) Porte une fonction amine sur C2 Porte une fonction cétone sur C6 Complémentaire à C |
Guanine |
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Nucléoside |
Le sucre s'associe à la base par une liaison N-glycosidique : - entre l'azote 9 de la base et le carbone 1' du sucre pour les purines - entre l'azote 1 de la base et le carbone 1' du sucre pour les pyrimidines |
Base + sucre |
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Nucléotide |
Liaison entre phosphate et le groupement hydroxyle du carbone 5' du sucre = liaison phosophoester Liaison entre différents phosphates = liaison phosphoanhydride Un nucléotide peut être monophosphate (NMP), diphosphate (NDP), triphosphate (NTP) 2 nucléotides sont liés par une liaison phosphodiester entre le OH 3' du nucléotide N et le ℗ en 5' du nucléotide N+1 |
Base + sucre + phosphate |
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ADN B |
Forme majoritaire dans les cellules Présente en milieu humide Double hélice à pas droit 2 chaînes antiparallèles reliées par des liaisons H entre bases complémentaires : A=T, C≡G Le squelette sucre phosphate est lisse et à l'extérieur et les bases à l'intérieur Les groupements phosphate sont chargés - à pH 7 Les bases azotées sont perpendiculaires à l'axe de l'hélice et s'empilent (stabilisées par liaisons de Van der Waals et interactions hydrophobes) Largeur : 20Å Bases espacées de 0,34nm Pas : 3,4nm ou 10pb/tour Les tours sont délimités par un grand sillon et un petit sillon (site de fixation des protéines) |
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ADN A |
Dans les spores bactériens Humidité < 75% Double hélice droite Pas : 11pb/tour Paires de bases inclinées par rapport à l'hélice Squelette sucre phosphate lisse Plus courte, plus large => plus compacte que l'ADN B |
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ADN Z |
Présente dans les cellules uniquement dans les régions formées de bases puriques et pyrimidiques en alternance Riches en alternance de CG Double hélice gauche Pas : 12pb/tour Squelette sucre phosphate en zigzag Fonction inconnue |
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ADN topoisomérases |
Augmentent/diminuent le surenroulement/nombre de supertours Se lient de manière covalente à un phosphate de l'ADN et hydrolysent la liaison phosphodiester sur 1 brin ou 2 La liaison est rétablie quand la topoisomérase quitte l'ADN Elles interviennent lors de la réplication (dérouler un tour d'hélice), la transcription (création de 2 supertours positifs devant l'ARN polymérase) et la réplication de l'ADN circulaire (séparation des 2 brins entrelacés)
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Chromosome eucaryote |
Suite linéaire de gènes séparés par des régions intergéniques Une molécule d'ADN et diverses protéines Linéaires de longueur variable Possèdent un centromère, 2 télomères, plusieurs origines de réplication |
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Gène |
Segment particulier d'ADN L'expression d'un gêne permet la synthèse d'une protéine ou d'un ARN fonctionnel (régule l'expression des gènes) |
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Génome procaryote |
Constitué d'un seul chromosome circulaire Présence éventuelle de plasmides : - contiennent de l'ADN circulaire de petite taille contenant peu de gènes - se répliquent indépendamment du chromosome - ne sont pas nécessaires mais permettent de s'adapter à l'environnement |
Particularité : plasmides |
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Génome eucaryote |
Isolé dans le noyau Constitué d'un nombre constant de chromosomes pour une espèce La plupart diploïde Les chromosomes sont par paires dont plusieurs paires de chromosomes homologues (autosomes) et une paire de chromosomes sexuels Certains organites ont leur propre génome (chloroplastes, mitochondries) Le nombre de gènes est fonction de la complexité de l'espèce |
Particularité : noyau et organites |
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Dénaturation |
Séparation des 2 brins d'ADN Obtenu par chauffage de la molécule Entraîne une augmentation de l'absorption des UV à 260nm : effet hyperchrome Phénomène réversible |
Fusion |
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Température de fusion |
Température à laquelle l'absorbance est augmentée de moitié Température à laquelle la moitié des bases de l'ADN ont perdu leur appariement Tm augmente quand la teneur en GC augmente |
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Hybridation |
Permet d'évaluer la parenté ente 2 brins d'ADN (si les brins sont complémentaires) Si les séquences sont identiques le réappariement est complet Si les séquences sont similaires mais non identiques il y a création d'une molécule hybride |
Dénaturation + renaturation |
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Extraction et purification de l'ADN |
1) Formation d'un lysat 2) Protéases 3) Extraction par le phénol : une phase organique contenant protéines et autres débris, une phase aqueuse contenant l'ADN 4) Récupération phase aqueuse 5) Précipitation de l'ADN par l'éthanol |
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Nucléase |
Enzymes qui peuvent couper, raccourcir ou digérer les molécules d'acide nucléique Peuvent être des RNases (ARN) ou DNases (ADN) Coupent une liaison phosphodiester de l'ADN |
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Exonucléase |
Coupe aux extrémités des acides nucléiques Libère par hydrolyse le nucléotide situé en 5' ou 3' |
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Endonucléase |
Hydrolyse une fonction phosphodiester interne Parmi les endonucléases se trouvent les enzymes de restriction |
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Exonucléase |
Coupe aux extrémités des acides nucléiques Libère par hydrolyse le nucléotide situé en 5' ou 3' |
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