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24 Cards in this Set

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Aminoacides rarement rencontres dans proteines

Hydroxyproline


Hydroxylysine


Desmosine


N-methylLysine, N-trimethylLysine


MethylHistidine

Aminoacides n'existant pas ds proteines

B-Alanine


HomoSerine


HomoCysteine


Ornithine


Citrulline


Canavanine


Acise djenkplique


B-CyanoAlanine

Comment est le caractere amphotere des a.a

Cation dans milieu acide (R-CHNH3+COOH)



Zwiterion (R-CHNH3+COO-)



Anion dans milieu alcalin (R-CHNH2COO-)



Reactions du groupe COOH (carboxyle)

-Formation amide


-Esterification par alcool (presence d'acide fort)


-Decarboxylation (formation d'amines) par chauffage en pres3nce de Ba(OH)2 ou enzymes



Desamination par acide nitreux HNO2

Formation d'acides-alcools et se degage d'azote


RCHNH2COOH -> R-CHOH-COOH + N2 + H2O

Desamination oxydative

S'accompagne par oxydation de C



Ex: alanine -> axide pyruvique + NH3

Action de ninhydrine



Action de ninhydrineAvec a.a bi sir pourpreAvec proline et hydroxyproline: jaune


Action du DNFB (reaction de Sanger)

Reagit avec fct amine



DNFB + aa -> HF + DNP-aa (jaune)



Cette technique determine l'a.a à l'extremite (mais il a fallu decouper toutes les liaisons dans peptide et avoir kelon a.a libres cad hydrolyse totale)

Action du PITC (reaction d'Edman)

Reagit avec grp amine (de toutes les aa)



PITC + peptide -> PTH-aa (cet aa est celui a l'extremite N-terminal) + reste du peptide intact (pas d'aa libres)

Reactions des chaines laterales

Liaisons faibles


Formation de pont disulfure S-S entre 2 Cysteine = donner Cystine

Chromatographie par echange d'ions

-Separation grace au comportement acide-base. Il ya resines echangeuses d'ions (de cations + d'anion).



-men nazil au prealable le pH a un pH acide (=3) et on augmente le pH progressivement et chaque a.a migre avec vitesses differentes selon pHi, et se fixent/detachent a pHi.



A pH acide, les a.a basiques st solidement liés a la resine, et a.a acides st moins liés.

Electrophorese

A.a migrent dans directions differentes, dependant du pH du systeme et de la force electromotrice appliqué (puisque chacun a pK' different)

Chromatographie de partage

Colonne remplie de grains d'une substance hydate hydrophile entouré par phase d'eau (phase stationnaire.


Par cette phase passe le solvant non missible wel grains agissent comme separateurs.


Les solutés migrent a des vitesses differentes.



On peut avoir carte bidimentionnelle si on utilise 2 solvant ds 2 directions.

Comment peptides sont nommés

Sens: du N-terminal au C-terminal

Que sont les liaisons peptidiques

Liaisons amides

Les peptides d'origine non proteique

-Glutathion


-Carnosine


-Tyrocidine A


Oxytocin+vasopressine


-bradykinine


-gramicidine


-valinomycine

Glutathion

Tripeptide Glu-Cys-Gly



Glu intervient par gamma-carboxyl ds la liaison (pas alpha)

Carnosine

Dipeptide musculaire


(B-AlanylHistidine)

Tyrocidine A

Antibiotique contenant a.a D

Oxytocine ey vasopressine

Nonapeptides: hormones post-hypophysaires

Bradykinine

Nonapeptide plasmatique



Regulation de la pression sanguine

Gramicidine

Antibiotique

Valinomycine

Decapeptide cyclique

Vasopressine bovine