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24 Cards in this Set
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Aminoacides rarement rencontres dans proteines |
Hydroxyproline Hydroxylysine Desmosine N-methylLysine, N-trimethylLysine MethylHistidine |
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Aminoacides n'existant pas ds proteines |
B-Alanine HomoSerine HomoCysteine Ornithine Citrulline Canavanine Acise djenkplique B-CyanoAlanine |
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Comment est le caractere amphotere des a.a |
Cation dans milieu acide (R-CHNH3+COOH) Zwiterion (R-CHNH3+COO-) Anion dans milieu alcalin (R-CHNH2COO-) |
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Reactions du groupe COOH (carboxyle) |
-Formation amide -Esterification par alcool (presence d'acide fort) -Decarboxylation (formation d'amines) par chauffage en pres3nce de Ba(OH)2 ou enzymes |
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Desamination par acide nitreux HNO2 |
Formation d'acides-alcools et se degage d'azote RCHNH2COOH -> R-CHOH-COOH + N2 + H2O |
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Desamination oxydative |
S'accompagne par oxydation de C Ex: alanine -> axide pyruvique + NH3 |
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Action de ninhydrine |
Action de ninhydrineAvec a.a bi sir pourpreAvec proline et hydroxyproline: jaune |
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Action du DNFB (reaction de Sanger) |
Reagit avec fct amine
DNFB + aa -> HF + DNP-aa (jaune)
Cette technique determine l'a.a à l'extremite (mais il a fallu decouper toutes les liaisons dans peptide et avoir kelon a.a libres cad hydrolyse totale) |
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Action du PITC (reaction d'Edman) |
Reagit avec grp amine (de toutes les aa) PITC + peptide -> PTH-aa (cet aa est celui a l'extremite N-terminal) + reste du peptide intact (pas d'aa libres) |
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Reactions des chaines laterales |
Liaisons faibles Formation de pont disulfure S-S entre 2 Cysteine = donner Cystine |
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Chromatographie par echange d'ions |
-Separation grace au comportement acide-base. Il ya resines echangeuses d'ions (de cations + d'anion). -men nazil au prealable le pH a un pH acide (=3) et on augmente le pH progressivement et chaque a.a migre avec vitesses differentes selon pHi, et se fixent/detachent a pHi. A pH acide, les a.a basiques st solidement liés a la resine, et a.a acides st moins liés. |
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Electrophorese |
A.a migrent dans directions differentes, dependant du pH du systeme et de la force electromotrice appliqué (puisque chacun a pK' different) |
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Chromatographie de partage |
Colonne remplie de grains d'une substance hydate hydrophile entouré par phase d'eau (phase stationnaire. Par cette phase passe le solvant non missible wel grains agissent comme separateurs. Les solutés migrent a des vitesses differentes. On peut avoir carte bidimentionnelle si on utilise 2 solvant ds 2 directions. |
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Comment peptides sont nommés |
Sens: du N-terminal au C-terminal |
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Que sont les liaisons peptidiques |
Liaisons amides |
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Les peptides d'origine non proteique |
-Glutathion -Carnosine -Tyrocidine A Oxytocin+vasopressine -bradykinine -gramicidine -valinomycine |
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Glutathion |
Tripeptide Glu-Cys-Gly Glu intervient par gamma-carboxyl ds la liaison (pas alpha) |
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Carnosine |
Dipeptide musculaire (B-AlanylHistidine) |
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Tyrocidine A |
Antibiotique contenant a.a D |
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Oxytocine ey vasopressine |
Nonapeptides: hormones post-hypophysaires |
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Bradykinine |
Nonapeptide plasmatique Regulation de la pression sanguine |
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Gramicidine |
Antibiotique |
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Valinomycine |
Decapeptide cyclique |
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Vasopressine bovine |
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