• Shuffle
    Toggle On
    Toggle Off
  • Alphabetize
    Toggle On
    Toggle Off
  • Front First
    Toggle On
    Toggle Off
  • Both Sides
    Toggle On
    Toggle Off
  • Read
    Toggle On
    Toggle Off
Reading...
Front

Card Range To Study

through

image

Play button

image

Play button

image

Progress

1/77

Click to flip

Use LEFT and RIGHT arrow keys to navigate between flashcards;

Use UP and DOWN arrow keys to flip the card;

H to show hint;

A reads text to speech;

77 Cards in this Set

  • Front
  • Back

Vilken storleksordning är de flesta mikroorganismer som studeras i Mikrobiologi?

10 mikrometer - 10 nanometer

Vad innebär Mikrobiologi, och vilka organismer ingår?

Läran om små levande organismer (mikroorganismer)


• Bakterier och Arkéer


• mikroskopiska Svampar


• Protozoer ”encelliga djur”


• mikroskopiska Alger


• Virus


(• Parasiter med encelliga stadier i livscykeln)

Allmänt om bakterier?

• Prokaryoter


• Binär fission


• Cellvägg av peptidoglykan


• Distinkt morfologi


• Energi från organiska ämnen, oorganiska ämnen eller kan fotosyntetisera

Allmänt om arkeér?

• Prokaryoter


• Cellvägg utan peptidoglykan


• Ofta extremofiler


• Distinkt morfologi


• Ofta CO2-fixering


• T.ex. Metanogener Extrem-halofiler Extrem-termofiler

Allmänt om svampar?

• Eukaryoter


• Cellväggar av kitin


• Kräver organiskt kol


• Mögelsvampar är multicellulära och är uppbyggda av mycel


• Jästsvampar är encelliga


• Absorberar löslig näring


• Förökning genom sporer eller knoppning

Allmänt om protozoer?

• Eukaryoter


• Kräver organisk kolkälla


• Saknar cellvägg


• Absorberar eller innesluter näring


• Kan vara rörliga mha pseudopodier, cilier, eller flageller

Allmänt om alger?

• Eukaryoter


• Cellväggar av cellulosa


• Fotosyntetiserar


• Producenter av molekylärt syre och organiska föreningar

Allmänt om virus?

• Ingen levande organism


• Kan ej föröka sig själva


• Obligata intracellulära parasiter i levande celler • Består av DNA eller RNA kärna omgiven av en proteinkapsid


• Vissa även omgivna av ett lipidmembran

Allmänt om parasiter?

• Eukaryoter


• Egentligen inte mikrober


• Parasitiska plattmaskar och rundmaskar kallas helminter.


• Har mikroskopiska stadier i livscykeln

Nomenklatur: Förklara hur namngivningen av bakterier går till?

• Carl von Linné år 1735, Systema Naturae


• Artnamn består av: släkte (genus) och artepitet


• Släktets namn skrivs alltid med stor bokstav medan artepitetet skrivs med liten bokstav, exempelvis Yersinia pestis.


• Första gången artnamnet anges skrivs hela ut, därefter kan man förkorta släktets namn, Y. pestis


• Latinska art och släktnamn skrivs alltid i kursiv stil


• Namnen kan vara beskrivande eller hedra en vetenskapsman

Förklara Koch´s postulat?

1. Organismen ska finnas hos alla sjuka värddjur, men ej hos friska.


2. Organismen ska kunna odlas.


3. Den odlade organismen ska smitta ett friskt värddjur.


4. Vid isolering av denna ska den vara identisk med tidigare odling.

Vad heter bakteriens små förvaringsorganeller?

Granula eller inklusionskroppar

Vad skiljer Arkeérs cellmembran och cellvägg från bakteriers?

Lipid monolayer. Fosfolipiderna har en svans och två huvuden. Cellvägg av pseudomurein istället för peptidoglykan (murein).

Vad sker genom poriner?

Diffusion och osmos.

Gram-positiv cellvägg består av?

40 lager peptidoglukan och teikoinsyra som håller fast den i membranet.

Gram-negativ cellvägg består av?

• 1-2 lager peptidoglykan


• Har yttermembran


• Lipopolysaccharid-lager (LPS)


• Periplasma, mellan membranen.

Vad är speciellt med mykobakteriers och mykoplasmers yttre?

Annorlunda cellvägg, till exempel syrafast. De senare saknar helt cellvägg.

Allmänt om endosporer?

• Överlevnads och viloform


• Högt differentierade celler


• Tål höga temperaturer torka, strålning, desifektionsmedel mm


• Idealiskt för spridning med vind, vatten eller fekalier


• Bara vissa grampositiva bakterier (ex Bacillus och Clostridium)


• Under gynnsamma förhållanden kan sporen gro och bilda vegetativ cell. Kan överleva i tusentals år

Var kan bakterier och arkeér få energi ifrån?

Ljus


Glykolys


Respiration


Väte oxidation


Svavel oxidation


Järn oxidation


Kväve oxidation


Oxidation av intermediära metaboliska substrat (fermentation)

Allmänt om Redox-tornet?

• Redox-tornet illustrerar spannet av möjliga reduktionspotentialer för redox-par i naturen


• Reduktionspotentialen (E0’) anger tendensen till oxidation eller reduktion hos en substans


• Den reducerade substansen i översta paret har högst tendens att donera elektroner och den oxiderade substansen i bottenparet har högst tendens att acceptera elektroner


• Det är inte elektrondonatorn i sig som innehåller energin utan det är den kemiska reaktionen donatorn deltar i!

Allmänt om fermentering?

• Anaerob katabolism


• Ger relativt lite energi


• Samma ämne är elektronacceptor och elektrondonator


• Fosforylering på substratnivå

Allmänt om aerob respiration?

• Oxidation där O2 utnyttjas som slutgiltig elektronacceptor


• Ger mer ATP än fermentation


• Glukos omvandlas först till pyruvat via glykolys


• Via citronsyracykeln blir pyruvat sedan helt oxiderat till CO2


• Protongradienten skapad av eletrontransportkedjan nyttjas till slut för att skapa merparten ATP

Allmänt om anaerob respiration?

• Har elektrontransport men använder inte O2 som elektronacceptor


• Liknande system som aerob respiration men ger mindre energi


• Assimilativ reduktion


• Reduktion (av t.ex. , NO3 -, SO4 2-, CO2) till aminogrupper o sulfhydryl grupper för användade i biosyntes


• Lagom kvantitet


• Dissimilativ reduktion


• stora mängder reduceras för att ge energi och produkten (N2, H2S, CH4) lämnar cellen

Allmänt om nitratreduktion/denitrifikation?

• Oorganiska kväveföreningar är de vanligaste elektronacceptorerna i anaerob respiration


• En av de vanligaste formerna är nitrat (NO3 -) som reduceras till gaserna N2, NO, N2O som lätt lämnar miljön, vilket kallas denitrifikation


• Denitrifikation är den största källan till N2

Allmänt om metanogenes?

• Arkeer


• Olika kolkälla:Koldioxid, acetat, metanol mm


• Kräver flera coenzymer och carriers

Allmänt om Fototrofi?

• Fotosyntes, omvandlar ljusenergi till kemisk energi


• Fotosyntes kräver ljuskänsliga pigment, s.k. klorofyll


• Fotoautotrofi kräver ATP-produktion och CO2 reduktion

Vilka är de prokaryota fototroferna?

Lila och gröna bakterier och cyanobakterier.

Allmänt om ej syreproducerande fotosyntes?

Ljus används enbart för att generera ATP gm fotofosforylering



CO2 reduceras med hjälp av ämnen i omgivningen (H2S, Fe2+, NO2- etc)

Allmänt om syreproducerande fotosyntes?

• Ljus används för att generera ATP och NADPH


• O2 bildas


• Innefattar två ljusreaktioner (fotosystem I och II) • “Z schema” där fotosystem II överför energi till fotosystem I


• ATP kan även genereras via cyklisk fotofosforylering

Allmänt om CO2-fixering?

• Det finns flera mekanismer, men Calvin-cykeln är vanligast i fotoautotrofer


• Kräver NAD(P)H, ATP och enzymen ribulose bisphosphate oxidase (RubisCO) samt phosphoribulokinase


• Övriga enzym ej specifika för Calvin-cykeln

Allmänt om kemolitotrofi?

• Oftast autotrofer, kan även vara mixotrofer (organisk kolkälla)


• ATP produceras genom elektrontransportkedja, men med reducerande kraft från den oorganiska föreningen eller från omvända elektrontransportreaktioner


Exempel på kemolitotrofi?

Aerob H2-oxidation


• Växlar mellan kemorganotrofi och kemolitotrofi beroende på nivåer av organiska föreningar och H2


Oxidation av reducerade svavelföreningar


• H2S, S0, S2O3 - • Sänker pH i omgivningen


Järnoxidation


• Fe2+ till Fe3+, Fe(OH)3 bildar fällning i H20 • Klarar oftas miljöer där pH <1


Nitrifikation


• Oxidation av NH3 via NO2- till NO3 • Delstegen nitrosofiering resp nitrifiering sker i olika bakteriegrupper • Ger lite energi, långsam tillväxt


Anammox


• Anoxisk ammoniumoxidation, NH4 + + NO2 - ger N2 + 2 H2O • Sker i membranomslutna strukturer, anammoxosomer. • Autotrofa, dock ej Calvincykeln

Allmänt om kvävefixering?

• Användandet av N2 som kvävekälla


• Fixerat kväve (NH3, NO3 -) viktigt i mikrobiella ekosystem, N2-fixering ger fördel


• Enbart vissa bakterier (inga eukaryoter) kan fixera N2


• Frilevande eller symbionter (sojabönan etc)


• Beroende av enxymet nitrogenas


• Mkt energikrävande process, ca 18 mol ATP för att fixera en mol N2


• Strikt reglerad

Vad heter det då septum bildas vid celldelning? Beskriv.

Divisomen


Divisomkomplex och FtsZ-ring stryper av cellens mitt, och delar den i 2 delar. Wall bands vandrar utåt och blottar growth zone på va sida om septum. MinE finner cellens mitt och attraherar FtsZ.

Vad krävs för bakteriell tillväxt?

Rätt fysisk mijö


Temperatur, pH, Osmotiskt tryck.



Kemiska näringsämnen


Kol, Kväve, svavel och fosfor, spårämnen, Syre, Organiska tillväxtfaktorer.

Gruppera efter optimal kardinaltemperatur, börja med den lägsta?

1. Psychrofiler


2. Psychrotrofer


3. Mesofiler (Trivs i människa)


4. Termofiler


5. Hypertermofiler

Hur påverkas de olika mikroorganismerna av pH?

• Flertalet bakterier växer i pH 6.5 - 7.5


• Svampar och jäst växer i pH 5 – 6


• Acidofiler växer is sura miljöer

Saltrika miljöer ger vad för miljö?

Osmotiskt tryck


• Hypertona lösningar orsakar plasmolys


• Extrema eller obligata halofiler kräver högt osmotiskt tryck för tillväxt


• Fakultativa halophiler tål högt osmotiskt tryck

Exempel på enzym som förstör toxiskt syre?

Katalas, peroxidas och superoxid dismutas

Allmänt om stammar och serovar? Typstam? Isolat?

• Varianter inom art kallas stam eller serovar.


• En sk typstam definierar arten


• Ett isolat är en renkultur gjord från en naturlig miljö.

Ge exempel på svårodlade bakterier?

• Mycobacterium leprae, “odlas” i armadillos (bältdjur)


• Många intracellulära bakterier t.ex. rickettsier och klamydier


• Patogena syfilis (en spirochete)

Vilka är de olika säkerhetsklasserna i laboratorier?

”Biosafety levels”


BSL-1, ex undervisningslab


BSL-2, öppet lab, handskar, labrock, ev mask och ögonskydd


BSL-3, höginfektiösa luftburna patogen. Arbetet sker i LAF-bänkar.


BSL-4, hantering av extremt farliga organismer. Slussade utrymmen med undertryck, filtrerat frånluft och skyddskläder

Hur kan man förvara mikroorganismer utan tillväxt?

• Djupfrysning -50 till -95 grader


• Frystorkning

Beskriv en biofilm?

• Mikrobiella samhällen


• Slem eller hydrogel


• Stackar och planktoniska celler


• Delar näring


• Motståndskraftiga mot förändringar i den yttre miljön

Hur är en köldanpassad mikrob annorlunda?

• Köldanpassade enzymer; mer flexibla i strukturen


• Mer α-helixar än β-flak


• Fler polära och färre hydrofoba aminosyror • Färre svaga bindningar


• Mindre interaktioner mellan proteindomäner • Transport processer fungerar optimalt vid låga temp pga modifieringar I cytoplasmamembranet


• Hög halt omättade fetter

Hur är en värmeanpassad mikrob annorlunda?

• Enzymer och proteiner fungerar optimalt vid höga temperaturer.


– Aminosyra substitutions som leder till värmetåligare proteinveckningar


– Fler jonbindningar stabiliserar veckningen


• Produktion av ämnen som stabiliserar proteiner


(e.g., di-inositol phophate, diglyercol phosphate)


• Modifierade cytoplasmamembran


– Bacteria har lipider med mättade fetter


– Archaea har monolager av lipider snarare än dubbellager

Ge exempel på tåliga mikrober?

• Acidofiler: organismer som växer bäst vid lågt pH (< 6) Stabilitet på cytoplasmamembranet är avgörande. Hos vissa obligata acidofiler förstörs membranen vid neutralt pH


• Alkalifiler: organism er som växer bäst vid höga pH (> 9) Vissa har natrium gradient snarare än protongradient (proton motive force) över membrandet pH hos extrema acido- och alkalifier kan vara så lågt som 4.6 och högt som 9.5!


• Halofiler: organismer som växer bäst med en reducerad vatten potential; kräver NaCl


• Extrem halofiler: kräver höga NaCl halter (15–30%) för att växa


• Halotolerant: organismer som klarar minskad vattenaktivitet men växer bäst utan extra salt


• Osmofiler: organismer som lever I miljöer med mycket socker


• Xerofiler: organismer som kan växa i mycket torra miljöer

Vad betyder sterilisering?

Avlägsnandet av allt liv, även sporer. (men ej prioner)

Vad betyder desinfektion?

Eliminera patogener, dock ej sporer.

Vad är antiseptik?

Desinfektion av levande vävnad.

Vad är aseptik?

Att förebygga uppkomst av mikroorganismer.

Vad är sanering?

Att minska antalet mikroorganismer till icke hälsovådliga nivåer.

Vad innebär rengöring?

Att mekaniskt avlägsna mikroorganismer.

Nämn de två mest resistenta, och de två minst resistenta mikroberna vid sterilisering?

Svårast att avdöda


1. Prioner


2. Bakterieendosporer



Lättast att avdöda


1. Virus med hölje


2. Gram-positiva bakterier

Vad påverkar antimikrobiella behandlingar?

• Membranpåverkan


• Proteiner


• DNA/RNA

Nämn 7 fysiska avdödningsmetoder?

Värme


Kyla


Tryck


Torka


Osmos


Strålning


Filtrering

Nämn 5 kemiska avdödningsmetoder?

Sterilanter


Desinfektionsmedel


Saneringsmedel


Antiseptika


Antibiotika/kemoterapeutika

Vad innebär termisk dödspunkt?

Det är den lägsta temperatur som dödar alla mikroorganismer i given lösning på 10 minuter.

Hur klassificeras/indelas organismer?

Domän


Rike


Stam/Fylum


Klass


Ordning


Familj


Släkte


Art


(Underart)

Latinska namnet för bagerijäst?

Saccharomyces cerevisiae


Den är encellig, äggformad och 5-10 mikrometer lång. Den förökar sig genom knoppning.

Exempel på enzymer som virus har i sin kapsid, som underlättar replikation?

RNA- och DNA-polymeraser.

Vad står MRSA för?

Meticillin Resistant Staphylococcus Aureus

Vad är kemotaxis?

En cells rörelse i riktning mot eller från en kemisk koncentration med hjälp av ATP.

Repressor, inducer. Vad är skillnaden?

En corepressorsaktiverad repressor hindrar transkription. En inducer tillåter transkription när den aktiverar en repressor som sitter hindrande.

Vad är peptidoglykan uppbyggt av?

Carbohydrate backbone av:


Acetylglukosamin


Acetylmureinsyra



Hålls samman av korslänkade aminosyror

Gasvesiklar består av?

Proteinerna GUPA och GUPC

Essentiella byggstenar?

C, O, N, H, P, S, Se.


Plus spårämnen, ex. metalljoner.

Vilka är de fyra kriterierna för att kunna kallas liv?

Egen metabolism


Reagens på yttre stimuli


Reproduktion


Nedärvning

Vilka odlingsmedier finns?

Definierat medium - Bestämt innehåll


Komplext medium - Obestämt innehåll, rikt på näring


Differentialmedium - Innehåller indikator


Minimalmedium - Exakt innehåll, näringsfattigt


Selektivt medium - Tillåter endast vissa organismer


Reducerat medium - ex. Anaerobt


Anriktingsmedie - Främjar vissa organismer

Ge ett exempel på 3 föreningar som kemolitotrofer oxiderar?

H2S, NH4+, Fe2+, CH2.

Hur lagrar bakterien energi?

Den lagrar ATP i polymerer i inklusionskroppar.

Förklara fermentation, hur mycket energi ger den?

Anaerob förbränning som ger 2 ATP/glukos. (kontra 38 vid CAC) Assimilativ användning bygger upp egna cellen, dissimilativ lämnar restprodukten till avfall.

Transposable elements?

Gener som kan ge upphov till variation genom att flytta på sig.

Vilka typer av plasmider finns?

R - Resistens


V - Virulens, gör patogen


D - Dissimilation, bryter ner


E - Epidomerer, integrerar med kromosomen

Hur många ORI och forks har en bakterie?

1 ORI, 2 forks. (Arkeér har fler) När forksen möts kallas det tear-site.

Hur skiljer sig transkriptionen i prokaryoter?

Den har sigma-faktorer som binder till olika saker. De har ett mindre polymeras, av 3-4 bitar. Den har även inverted repeats, snuttar som binder sig till den nyskapade kedjan och terminerar transkriptionen.

Hur kan proteiner transporteras genom membran?

Sekretoriska proteinet SecA binder till leader protein (signalsekvens) och för proteinet ut till periplasman.