• Shuffle
    Toggle On
    Toggle Off
  • Alphabetize
    Toggle On
    Toggle Off
  • Front First
    Toggle On
    Toggle Off
  • Both Sides
    Toggle On
    Toggle Off
  • Read
    Toggle On
    Toggle Off
Reading...
Front

Card Range To Study

through

image

Play button

image

Play button

image

Progress

1/114

Click to flip

Use LEFT and RIGHT arrow keys to navigate between flashcards;

Use UP and DOWN arrow keys to flip the card;

H to show hint;

A reads text to speech;

114 Cards in this Set

  • Front
  • Back

Ofta beskrivs släktskapsförhållanden inom Bacteria och Archaea mha "träd". Förklara kort vad problemet med detta är?

Prokaryoter kan föra över gener via horisontell genöverföring och beroende på vilket träd vi kollar på får vi helt olika släktskap mellan arter.


Bättre med fylogenetiskt nätverk än genträd.

Vilken egenskap kan tillskrivas rangen "fylum" i den fylogenetiska taxonomin?

Fylum = Stam


Ex. Chordata (ryggsträngsdjur).




- Domän (eukaryoter)


- Rike (djur-, växt-, svamp)


- Fylum/stam (chordata/ryggsträngsdjur)


- Subfylum/understam (vertebrater/ryggradsdjur)


- Klass (däggdjur)


- Ordning (rovdjur)


- Familj (kattdjur)


- Släkten (storkatter)


- Arter (lejon)


- Underarter (asiatiskt lejon)

Förklara skillnaden mellan genträd och artträd.


Ge ex. på biologiska processer som kan förklara varför de kan vara olika?

De avser olika organisationsnivåer och kan förväntas vara olika då följande förekommer:


- Hybridisering (Homo- (ovanlig) eller Polyploid = summan av föräldrarnas kromosomer = vanlig)


- Horisontell genöverföring (transformation, transduktion, konjugation)


- Ofullständig linjesortering (genträden skiljer sig från artträden. Ex allelerna har delat på sig innan arten bildades)




Relationerna bör då istället beskrivas med nätverk. Genfylogenierna är dock fortfarande träd.


Kan även förväntas vara stora skillnader mellan art/genträd om artträdet är kort & populationerna stora

Vad är sympatrisk artbildning?


Ge ett ex. på hur det kan gå till?

- Artbildning utan fysiska barriärer. Ex. via värdbyte vid ex. äggläggning, olika preferens för detta, hagtorn vs. äpplen = arten separeras pga olika preferens.


- Ganska ovanlig


- Snabb

Beskriv varför allopolyploida hybrider är reproduktivt isolerade från sina föräldrar.

Allopolyploid = kromosomuppsättning från två eller fler arter (kromosomtalsfördubbling)




Hybrid fertil men kan ej korsas med föräldrarna. Korsning av två annars relativt inkompatibla arter.




Ex. på sympatrisk artbildning (=utan fys. barriär)

Autopolyploidi?

Kromosomtalsfördubbling inom en art. Mindre vanligt än allopolyploidi.

Beskriv prezygotiska och postzygostiska barriärer mot hybridisering och hur de kan påverkas av naturlig selektion.

Prezygotisk:


- Sammansmältning av gameter förhindras.


- Isolering av habitat (i olika miljöer)


- Olika reproduktionstid på året


- Könsorg. passar ej ihop


- Olika parningsbeteenden


- Gameter sammansmälter ej trots befruktning




Postzygotisk:


- Hybridzygot ej livskraftig


- Vuxen hybridindivid ej livskraftig.


- Hybriden steril.

"Ekotypteorin" är en teori som har lanserats som ett alternativ till det "prokaryota" artbegreppet. I denna teori beskrivs två mekanismer som kan hålla nere diversiteten i gruppen. Vilka och hur fungerar de?




Vilka invändningar finns mot teorin?

Diversiteten minskar pga periodisk selektion och genetisk drift.




Periodisk selektion: Gener kan ej föras över en och en eftersom de klonar sig och då följer hela genom med inkl. mutationer.




Genetisk drift: Slumpen gör att alla genetiska varianter ej kommer med i nästa generation.




Invändningar: Populationer är aldrig helt isolerade. Har horisontell genöverföring vilket gör att mutationer enkelt kan föras ut ur populationen till en annan.

Förklara vad ett fylogenetiskt träd är? Rita ett rotat sådant med fem terminala taxa och förklara begreppen; systergrupp, monofyli och homoplasi.

Fylogeni = evolutionärt släktskap mellan taxa, genom, kromosomer, gener eller alleler. Kan representeras av träd eller nätverk.




Systergrupp: två monofyletiska grupper som utvecklats ut en gemensam anfader och är varandras närmaste släktingar.




Monofyli: Organismgrupp som delar gemensamt ursprung. Känns igen på synapomorfier.




Homoplasi: Morfologisk/genetisk likhet mellan två taxa som ej uppkommit genom nedärvda karaktärer från en gemensam anfader.

Förklara parsimonprincipen (Occam's rakblad)

Att ej anta fler företeelser eller ting än som behövs för att förklara de observationer som görs. Välja den förklaring som kräver minst antal antaganden/förklaringar.



Lineage Species Concept.




Inom vilka organismgrupper är detta applicerbart eller ej?



Lineage Species Concept: Arter föds vid artbildningstillfället och dör pga utdöende eller ny artbildning.




Ej applicerbart på Prokaryoter (Bacteria & Archaea) eftersom deras genom förs vidare genom celldelning.





Biologiska Artbegreppet.


Applicerbart på?

Grupp individer vilka under naturliga förhållanden kan reproducera sig med varandra och samtidigt är reproduktiva isolerade från andra sådana grupper.


Kan testas experimentellt, frå A & B avkomma?




Applicerbart endast på sexuellt reproducerande organismer.

Problem med Biologiska Artbegreppet?

A kan vara korsningsbar med B som kan korsas med C, men C kan inte korsas med A (Ring Species)




Många väl skilda populationer kan korsas, trots att de kanske ej gjort det i naturen sedan väldigt lång tid tillbaka.

Vilka forskningsresultat stödjer endosymbiontteorin?

Mitokondrier (M) & Kloroplaster (Kl) har...


- egna cirkulera kromosomer


- inga histoner


- translation lik bakteriers


- start-AS samma som hos prokaryoter


- transkription & replikation sker i M & Kl


- cell kan ej bilda egen M & Kl om de ej finns i cellen från början


- en del Kl har membran som liknar G-negativa bakterier.

Vilka undergrupper delas Proteobacteria in i?


Vad baseras indelningen på?

alfa - purpur icke-svavel bakterier


beta - kända svaveloxiderare


gamma - mikroaerofila, måste ha O2 men ej för mycket.


delta - desulfogruppen, viktig för svavelomsättning i marina sediment.


epsilon




Vet ej vad idelningen baseras på? Kan vara rRNA-sekvenser, men oklart, de flesta grupperna är monofyletiska (egen taxa).

Vad kännetecknar gruppen Planctomyceter?

(grupp utanför proteobacteria)


- Många intracellulära membransystem


- En del av cytoplasman har ej kontakt med kromosomen.


- Vissa har membran som liknar kärnmembran


- Vissa är anamoxa och har extra membran där energimetabolism sker.




Övriga icke-proteobacteria är: Mollicutes, Actinobacteria, Firmicutes, Cyanobakterier samt Chloribi och Chloroflexi.

Archaea vs. Bacteria

Archaea:


- Saknar arter med Fotosyntes


- Ej patogena för människan


- Ej peptidoglukan


- Finns metanbildare


- Membran fungerar bra vid olika temperaturer (annorlunda membranlipider än Bacteria).

alfa-proteobacteria


nämn en intracellulär parasit och vilken/vilka organismer den parasiterar på.




Vad mer ingår här?

(purpur icke-svavelbakterier, kan ha fotosyntes)




Wolbachia - intracellulär parasit hos insekter och vissa nematoder. Påverkar egenskaper hos värddjur, ex. flygförmåga.




Rizobium - genöverföring mellan prokaryot och eukaryot. Invaderar rötter hos växter.




Richettsiales - mitokondriens närmsta släkting, har CSC som aerob respiration.

Vad kännetecknar bakteriegruppen Mollicutes (Mycoplasmor)

Saknar cellvägg, de flesta är parasiter. Påverkas ej av penicillin.




Är en av grupperna utanför proteobacteria.

Rickettsia prowasekii

Mitokondriens närmaste nu levande släkting.


Har CSC och aerob respiration.




Går under Rickettsiales som tillhör alfa-proteobacteria.

Vad kännetecknar gruppen Clostridia?

Strikt anaeroba, många använder jäsning.


De flesta är sporbildande (endosporer), tåliga vanliga i jord.




Botulism - matförgiftning. Nervgift - stelkramp.




Går under Firmicutes tillsammans med Bacilli.

Vad skiljer Euryarchaeota från andra Archaea?

Skiljs från andra främst genom rRNA-sekvenser.




Har ingen cellvägg.


Metanbildare (metanogener)


Halofila (många)




(en av tre fyla, de andra två är Crenarchaeota & Thaumarchaeota)

Vilka två sporbildare finns inom Firmicutes? Liketer och skillnader mellan dessa grupper?

Clostridia: Strikta anaerober


Sporbildnade - endosporer


Många giftiga, ex. stelkramp




Bacilli: Aeroba eller fakultativa anaerober.


Sporbildande - endosporer.


Många bra, ex. mjölksyrabakterier.

Vad kännetecknar filamentära Cyanobacteria & vilka speciella differentierade celler kan de bilda?

De kan bilda heterocyster som fixerar kväve vid kvävebrist = specialiserade celler.


Växer ofta i filament (= har kontakt med varandra) De flesta kan bilda heterocyster vid kvävebrist.


Har ofta glidande rörelse mot underlag.

Ange en viktig egenskap som skiljer Thaumarcheota från de flesta andra Archaea. Finns denna egenskap hos andra prokaryota organismer?



Ammoniumoxiderare (AOA), oxiderar ammonium (NH4+) till nitrit (NO2-).




Finns även inom Bacteria (AOB).




(är ett av tre fyla under Archaea)

Miljön på jorden vid tiden för livets uppkomst?

Reducerande, anaerobt, varmt, UV-strålning.

Nämn en grupp inom gamma-proteobacteria, vad kännetecknar den gruppen?

Chromatiales - Strikta anaerober, elektrondonator = reducerat svavel




Vibrionales - fakultativa anaerober, flesta akvatiska, många bioluminiscens.




Pseudomonadales - flageller, heterotrofer, viktiga nedbrytare, vissa patogener.




Thiotickales - Mikroaerofil, kräver syre men ej för mycket.

Två viktiga egenskaper somskiljer de flesta Crenarchaeota från de flesta Thaumarchaeota?

Cren. är för det mesta (hyper)termofiler


Thau. är ammoniumoxiderare (AOA)

Beskriv de två grupper av fotosyntetiska bakterier som ingår i Proteobacteria.

alfaproteobacteria - Rhodospirillum rubrum; har många möjligheter till energiproduktion, fotosyntes är en av dom.




gammaproteobacteria - Chromatiales; red. svavel som e-donator i fotosyntesen. Kan kortvarigt lagra svavelkorn i/utanför cellerna.

Redogör för följande morfologiska strukturer/begrepp och ge ex. på en grupp inom kärlväxterna där strukturen förekommer.


- Arkegon


- Mikrofyll


- Hypogyni


- Synkarpi

Arkegon: Flaskliknande honorgan hos stamväxterna; mossor, ormbunkar, och fanerogamer.




Mikrofyll: Lummerväxternas blad




Hypogyni: Blombotten platt med hyllet infästat under pistillen




Synkarpi: Sammanväxta karpeller (fruktblad), hos gömfröiga växter.

Vilket mossfylum kännetecknas av nervlösa ibland flikiga blad med runda celler som ofta är försedda med oljekroppar?

Hepatophyta (Levermossor)

Barrväxternas honkottar består i typiska fall av två fjäll, vad kallas dessa fjäll?

Täckfjäll och Fröfjäll

Vilken angiospermfamilj passar in på följande beskrivning?




Örter, sällan träd eller buskar, med strödda blad. Blommorna är bisymmetriska och består vanligen av fyra fria kronblad och sex ståndare. Frukten är en sk. skida.

Brassicaceae

Vilken angiospermfamilj passar in på följande beskrivning?




Träd med strödda blad och stora fasta stipler, vilka bildar knoppfjäll. Blommorna är stora och ensamma och har ett långsträckt blomfäste där talrika ståndare och pistiller sitter infästande i spiral. Varje pistill består av en karpell (apokarpi) och mognar till en baljkapsel.

Magnoliaceae

Blommorna hos de sk Asteridierna kännetecknas av att de ofta är tetracykliska och sympetala.


Vad innebär dessa begrepp?

Sympetal = sammanväxta kronblad


Tetracyklisk = tetra = 4 ordnade blomkransar vilka är alternerade sinsemellan.

Mikrosporofyllen hos de flesta angiospermer består av två delar. Vad kallas dessa i dagligt tal och vilka är dessa två delar?

(Blad som bär hanfertila delar)




Ståndare (blad som bär sporangier)


= består av knapp & sträng

Beskriv en blomma typisk för Liliaceae (ex. Tulpan) och redogör för ståndarnas olika delar och antal, samt pistillens byggnad och placering i förhållande till hyllet.

Sex ståndare.


Hypogyni = undersittande hylle, infästat under pistillen, blombotten platt.


Två kransar av tepaler


Nektarier vid basen

Arterna i familjen Selaginellaceae är heteromorfa generationsväxlare som alla kännetecknas av att de är heterospora. Redogör för de två begreppen och nämn ytterligare en landväxtgrupp (utom Lycopodiophyta = lummerväxter) med dessa egenskaper.

Heteromorf gen.växlare: två olika morfer/utseenden i de olika generationerna (diploida & haploida stadierna).


Synapomorfi hos mossor & kärlväxter.




Heterospori: Sporofyt bildar två slags sporer; mikro- och megasporer.




Ex. hos Coniferophyta (Barrväxter)

Redogör för följande morfologiska strukturer/begrepp & ge ex. på en grupp inom kärlväxterna där strukturerna förekommer.


- Heterospori


- Inducium


- Strobilus


- Synangium

- Heterospori: Sporofyt som bildar både mikro- och megasporer.


Ex. hos: Lycopodiophyta.


- Inducium: Täcker & skyddar sporgömmen hos ormbunkar, växer från epidemis.


Ex. hos: Pteridophyta (Ormbunksväxter)


- Strobilus: Kotte, blomma eller blomställning hos nakenfröiga växter (sporangioforsamling).


Ex. hos: Ormbunksväxter (ex. Fräkensläktet)


- Synangium: Sammansmälta sporangier.


Ex. hos ormbunksväxterna.

Redogör i detalj för småaxets byggnad hos ett typiskt gräs (Poaceae) inkl. reproduktiva strukturer.

Varje småax har blommor som stöds av två skärmfjäll som sitter längs ner (stödblad).
Blommor sitter i vecket av ytteragnet (också ett stödblad).
Varje blomma har ett inneragn.
Pistill synkarp med ett fröämne.
Vanligen bara två märkesl...

Varje småax har blommor som stöds av två skärmfjäll som sitter längs ner (stödblad).


Blommor sitter i vecket av ytteragnet (också ett stödblad).


Varje blomma har ett inneragn.




Pistill synkarp (sammanväxta karpeller) med ett fröämne.


Vanligen bara två märkeslikar.


Frukt där fröskal & fruktvägg är hopvuxna.



Perenna (ibland annuella) örter m jordstam, lök eller stamknöl. Bladen ofta svärdslika (ensiforma) & har unifacial skiva. Blommora, som är epigyna, sitter i axlik blomställning eller vippa av ensidiga knippen där varje blomma vanligen har tre ståndare. Frukten är en kapsel.

Iridaceae

Iridaceae

Blommorna hos de sk asteriderna kännetecknas av att de ofta är tetracykliska och sympetala, vad innebär dessa begrepp?

Sympetala: Karaktäriseras av sambladig krona, sammanväxta kronblad.




Tetracyklisk: Fyra ordnade blomkransar vilka är alternerade sinsemellan.

Beskriv i stora drag hur gametofyten har utvecklats hos landväxter (från mossor, via lummer- & ormbunksväxter till gymnospermer och angiospermer).

En sexuellt reproducerande växts haploida livsfas. Gametofyters celler innehåller en enkel uppsättning kromosomer (n).


Gametofyten har gametangier som innehåller gameter. Gametofyten kan vara rent honlig, rent hanlig, eller tvekönad.

In the context of gene evolution, briefly explain the "Exon Shuffling Theory" and provide at least one evidence that it occurs.

Formation of new genes, a process where two or more exons from different genes can be brought together, or the same exon can be duplicated, to create a new exon-intron structure.




Evidence: Intron phase matching, the "splice fram rule" states that a newly aquired axon will be flanked by phase-matched introns.

The so-called "Molecular Clock" is a technique that can be used to estimate the amount of time that separates two species. Does this "clock" go faster or slower in a small population, or is it unaffected by population size? Justify your answer.

The speed is unaffected. As long as there is a constant mutation rate, neutral mutations happens in a constant rate which is unaffected by population size.

In the context of the evolution of genes and genomes, define the concept of


"Lateral Gene Transfer" & provide one ex.

Transmission of genes from species to species, between individual cells.


Ex. Vertebrate vasodilarity hormone into ticks.




Sidleds/horisontell genöverföring av enskilda gener, organceller & fragment av genom.


Hybridisering resulterar i högt antal överförda gener mellan arter, upptag av DNA-fragment från miljön.


(Inte mor-dotter-överföring)

Similarity matrix (draw) for the aligned sequences.


1. LFFTYRLRPFCT


2. LFFT-RGRPFCT


3. LFFTYRLRPFCT


4. LFSDYRLRPFCT

Summary of the number of similar & different AS or nucleotides among sequences.

Summary of the number of similar & different AS or nucleotides among sequences.

Vad är Periodisk Selektion?

I en population där alla individer har samma genuppsättning kan en positiv mutation särskiljas från resten av genomet och därför selekteras hela, inga andra genuppsättningar blir sedan kvar (viss diversitet kan uppstå mellan dessa tillfällen).

Förklara kortfattat begreppen:


Taxon


Anagenes


Monofyli


Homologi

Taxon - Systematisk grupp organismer, ex. arter, släkten, familjer.


Anagenes - Gradvis förändring av art/pop. ofta svar på miljöförändring, kan leda till artbildning.


Monofyli - Gemensamt ursprung, känns igen på synapomorfier.


Homologi - Likhet pga gemensamt ursprung, ej likhet i sig. De tre homologihypoteserna; Likhet, Placering, Kongruens (ex. vingar-armar)

Förklara begreppet ofullständig linjesortering


(Incomplete Lineage Sorting)

Genom att jämföra gensekvenser mellan arter så behöver ej släktskap se ut på samma sätt som när man ser till senaste gemensamma anfader.


Populationer går olika vägar men tar med genetisk diversitet.

Förklara Allopatrisk artbildning.

Fysisk barriär förekommer


Gradvis isolering


Resulterar i systerarter


Vanligt förekommande


Del av pop. åtskiljs och isoleras, denna dotterpopulation utvecklas sedan åt ett annat håll än moderpopulationen.

Under antagandet att mutationshastigheten är konstant, vilken sekvensregion är mest lämplig för att skatta åldern av den gemensamma förfadern till två eukaryot arter? Motivera.

Cytokrom C-genen, då den är väldigt väl konserverad i genomet.

Vissa organismers genom är överraskande stora. Ex är salamanderns genom ca 40ggr större än människans. Det finns i huvudsak två hypoteser för att förklara dessa "onormala" genomstorlekar. Vilka?

Size of genome could reflect efficiency of junk removal (transposons, repeats etc.). Smaller genome = faster junk removal.


Population size - small pop. the effect of genetic drift can overwhelm the selection against junk-DNA.


In some cases a large genome can be used to slow down development rate.

Nämn en växtfamilj som kan ha både zygomorfa och radiärsymmetriska blommor i samma blomställning.

Asteraceae

Asteraceae

Vilken angiospermfamilj passar in på följande beskrivning:


Lökväxter m speciella alkaloider & flocklika blomställningar m utvecklade stödblad. Blommor epigyna m fria eller hopvuxna tepaler & vanligen sex ståndare. Frukt vanligen kapsel, ibland bär.

Amaryllidaceae

Amaryllidaceae

Vilken angiospermfamilj passar in på följande beskrivning:


Örter med strödda blad utan stipler. Blomman har ett fyrtaligt, undersittande hylle, ståndarna är sex till antalet och pistillen består av två karpeller vilka utvecklas till en sk skida.

Brassiaceae

Hur benämns de innersta bladen i angiospermblomman (de som utvecklas sist) och vad kallas strukturen som en eller flera av dessa bildar tillsammans?

Inifrån och ut:


Pistill = består av fruktblad (karpeller)


Ståndare = sträng + knapp (mikrosporofyll)


Hylle = foder- & kronblad, kan vara sammansatta eller fria.

Vad är Core-genom och Pan-genom? Det finns en tanke om att strl-förhållandet mellan dessa hos en organism säger något om den miljö org. normalt lever i.

Core-Genome: Gener som finns hos alla inom en viss grupp. Gener typiska för centrala funktioner som ex. realisation, transkription & translation.




Pan-Genome: Gener som ej finns hos alla inom en viss grupp. Gener typiska för utvidga en organisms kolonisering av nya nischer, ofta överförda horisontellt.




Förhållandet core/pan visar ungefär om organismen finns i konstant eller föränderlig miljö.

Inom alfa-proteobacteria finns gruppen Rhodospirillum. Dessa bakterier har många olika mekanismer för sin energiproduktion och kolförsörjning. Nämn de olika mekanismerna & ange mkt kort vilka miljöförhållanden som styr hur organismen använder dessa mekanismer.

O2 - Ja = Respiration

O2 - Nej -> Ljus - Ja -> 
Org. C - Ja 
= Fotoheterotrof
Org. C - Nej 
= Fotoautotrof

O2 - Nej -> Ljus Nej
= Fermentering

O2 - Ja = Respiration




O2 - Nej -> Ljus - Ja ->


Org. C - Ja


= Fotoheterotrof


Org. C - Nej


= Fotoautotrof




O2 - Nej -> Ljus Nej


= Fermentering

Ge ex. på två olika bakteriegrupper som kan fixera N2. Ange namn på grupperna och ge en kort beskrivning av grupperna.

Cyanobakterier - filamentösa, bildar heterocyster och ger upp celldelning för att fixera N vid brist på detta.




alfa-proteobacteria


Rhizobium - kvävefixerar i symbios m ärtväxter. Invaderar växtrötter, lämnar kväveföreningar från växten, får i utbyte organiska ämnen.




gamma-proteobacteria


Pseudomonadales - viktig nedbrytare i både jord och vatten. Vissa är patogener (cystisk fibros)

Describe how a transposon has likely contributed to the evolution of the complex genes that encode antibodies in vertebrates. Your answer need only explain the likely origin of the complex loci, and not how they are today expressed to generate antibody diversity.

RAG - recombination activating gene


RAG1 & 2 "hoppar" till & binder till genreceptor och genreceptorn bryts upp och rekombination sker mha RAG1/2

What great genetic event took place act 350 million years ago and likely contributed to the species explosion in teleost fish.




Why did that genetic event facilitate the evolution of novel (nya) species?

Teleost fish = a whole genome duplication. (Diploid till Tetraploid)


Duplicated genomes allow rapid diversification of novel species ex. teleost fish radiation




(Duplicated genes can acquire new functions ex. voltage gated Na-channels in electric fish.)

Vad har följande phyla gemensamt. Oomycota Bacillariophyta, Chysophyta och Phaeophyta?

Alla hör till gruppen Stromanopiles och kännetecknas av att de har två flageller. En hårig och en pisksnärtsflagell.

Rödalger (Rhodophyta) har många unika karaktärer om man jämför med andra algfyla.


Vad är typiskt för deras hangameter?


Vad gör att de kan växa på stora djup?


Hur många generationer har de i sin livscykel och hur många är haploida respektive diploida?

Hangameter inga flageller (orörliga).

Pigmentet Fycoerytrin absorberar bra vid låg mängd grönt/blågrönt ljus, kan därför växa djupt.


Generationsväxling med ett gametofyt- och två sporofytstadier, alltså tre generationer.


En haploid (gametofytgenerationen)


Två diploida (sporofytgenerationer)

Vad är Red-tides, och vilket fylum orsakar dessa?

Det är toxiska algblomningar som orsakas av Chromalveolater som; kiselalger, dinoflagellater och haptofyter.

Vilken protistgrupp är närmast släkt med landväxterna? Nämn en karaktär (synapomorfi) som de delar med landväxter.

Plantae - Chlorophyta - Grönalger

(och Kransalger).


Synapomorfi är klorofyll b



Namnge och redogör kort för minst två naturliga processer som kan leda till topologiska skillnader mellan art- och genträd.

Om horisontell genöverföring eller hybridisering mellan arter förekommer.



Horisontell - ex. upptag av fritt DNA hos ex. bakterier.




Hybridisering - avkomma från två olika arter som korsats.

Beskriv i detalj begreppet Heteromorf Generationsväxling samt namnge den största grupp som kännetecknas av denna egenskap (Claes).

Heteromorf = olikformighet, uppvisar olika former eller strukturer (ex. mossor).



Innebär att den haploida och den diploida generationen ser helt olika ut (NE).

Vad innebär det att en art är Dioik och vad är den fundamentala skillnaden mellan en Dioik Angiosperm och en Dioik Mossa (Claes)?

(monoik bildar gametangier på samma individ


= på gametofyten)



Dioik = hon- & hangameter bildas på skilda individer.




Dioik Mossa: bildar arkegon (honorgan) och anteridier (hanorgan) på olika individer. Gametofyten är den mest synliga fasen av livscykeln.




Dioik Angiosperm: Trädet är sporofyten. Bildar blommor/hon-/hankottar på olika sporofyter.


Ex. Juniperus & Taxus




(Hos mossor är gametofyten den mest synliga fasen av växtens livscykel, hos ormbunkar är sporofyten den stora generationen. Hos blomväxter är sporofyten alltid mycket dominerande.)



Till vilket mossfylum hör en art som har följande egenskaper: Blad i tre rader (två rader m stora och en rad mindre blad), celler korta och rundade innehållande karaktäristiska oljekroppar.

Hepatophyta - Levermossor

Den sk embryosäcken är en unik struktur som utvecklas inne i angiospermernas blommor. Vad kallas embryosäckens motsvarighet hos lummersläktet Selaginella. Termen är också den som används generellt för strukturen.

Arkegon - honorganet hos stamväxterna, det vill säga hos mossor, ormbunksväxter och fanerogamer

Rödalger har två unika karaktärer i sin livscykel, vilka?

Den har tre generationer:


En haploid gametofytgeneration (n)


Två diploida sporofytgenegationer (2n)

Många mikroskopiska protister är Mixotrofa. Vad betyder det och ge ex på ett fylum där detta är vanligt.

En näringsstrategi hos bakterier.


Kan utnyttja oorganisk förening som e-donator och energikälla. Kolkällan kan beroende på tillgång vara oorganisk eller organisk.


Fylum:

Två grupper av grönalger ligger närmast landväxterna. Nämn en av dessa grupper och ge ex på en synapomorfi som de har gemensamt med landväxter.

Chlorophyta = grönalger


Charophyta = kransalger




Klorofyll b (accesoriskt pigment) gemensamt med landväxterna.

Beskriv minst Fyra Unika Karaktärer hos Landväxterna som utgör viktiga anpassningar för landliv.

n

Var i livets träd placerar sig Glaucophyta, vilken är systergruppen?



Plantae -> rödalger systergrupp (Rhodophyta)


Båda har cyanobakterieliknande kloroplaster & samma accesoriska pigment som dessa (fycobiliner).

Vilken är landväxternas systergrupp? Ett ex på en karaktär som de delar med landväxter?

Kransalger - Charophyta


Förgrenad apikal tillväxt, äggcell behålls på


moderplantan (omsluts)

Vad kännetecknar gruppen Planctomyceter?

Saknar peptidoglukan i cellväggen.


Akvatiska bakterier.


Har intracellulära membransystem, har alltid intracytoplasmatiskt membran innanför cellmembranet.

Nämn två stora grupper som uppkommit genom primär endosymbios.

Rödalger


Cyanobakterier

Hos protisterna finns flera typer av livscykler: haplontiska, diplontiska och generationsväxling.


Vad betyder dessa.


Diplontisk: i vilket skede sker meiosen? och ge ex på grupp där sådan livscykel förekommer.

Haplontisk (zygotisk meios) - Endast zygot har ett diploit (2n) stadie. Zygot går sedan direkt till meios & bildar haploida (n) sporer.




Diplontisk (gametisk meios) - Endast könsceller som är haploida (n), organismen diplontisk (2n) genom hela livet. Hos flesta djur, brunalger. Ex: Diatoméer.


Meiosen sker



Många makroskopiska alger har generationsväxling, ge ex på släkte där man hittar en heteromorf gen.växling.

köns- och spargenerationen ser olika ut i generationsväxlingen.Ex. Stramenopiles - Brunalger (Kelp) se PP!


Konjunktion förekommer hos flera eukaryot grupper. Vad betyder detta och ge ett ex på där det förekommer.

Sammansmältning som bidrar till diploid zygot, typ av sexuell reproduktion. Ex. hos grönalg.

Nämn en egenskap som är gemensam för följande taxa; Oomycota, Bacillariophyta, Chrysophyta och Phaeophyta

De tillhör alla Straminopiles (Heterokonta)


Alla har flageller, två st, en nakel pisksnärts och en behårad.




Oomycota (algsvampar)


Bacillariophyta (kiselalger, diatomeer)


Chrysophyta (guldalger)


Phaeophyta (brunalger)





Rödalger (Rhodophyta) har många unika karaktärer.


Vad är typiskt för deras hangameter?


Vad gör att de kan växa på stora djup?


Hur många generationer har de i sin livscykel och hur många haploida resp. diploida?

De är gissellösa.

Ljusabsorberande pigment, andra än klorofyll.


Tre generationer; en haploid (gametofytgen), två diploida (sporofytgen.)





Förklara vad som menas med primär endosymbios samt ge ett ex på en grupp man tror har utvecklats därur.

Rödalgers kloroplaster från cyanobakterier, tagits upp genom endosymbios.


Fagocytiska eukaryoter inkorporerade proteobakterier som utvecklades till mitokondrier.

Diplontisk livscykel

gametisk meios


bara könsceller som är haploida, organismen är diploid genom hela livet.

Haplontisk livscykel

zygostisk meios


endast zygoten som har diploidstadie vid befruktningen. Zygoten går sedan direkt till meios och bildar haploida sporer.

Generationsväxling

sporisk meios


organismer som växlar mellan flercellig diploid fas (sporofyt) och en flercelliga haploid fas (gametofyt).


Den diploida sporofyten producerar haploida sporer vid meios.


Sporerna utvecklar sig till haploida gametofyter som producerar könsceller vid mitos.


Livscykeln fullföljs när könscellerna smälter samman till en diploid zygot som växer upp till en ny diploid sporofyt.

Vad innebär isomorf generationsväxling?

isomorf = strukturlikhet


att den haploida och diploida generationen ser likadana ut.

Gruppen Stramenopiles har en gemensam karaktär map flagellerade celler, vilken?

Förekommer hos alla i gruppen.


De har två flageller, en behårad och en naken pisksnärtsflagell.

En stor brunalg på flera meter har flera anpassningar för att hålla bålen upprätt för att på så sätt fånga ljus för fotosyntes. Nämn två anpassningar.

Luftblåsor som hos Fucus Vesiculosus för ökad flytförmåga.


Förmåga att binda in vätska och få densitet lik den för vatten vilket gör den mer "svävande" i vattenmassan.

Vad är det för skillnad på rotsystemet hos en lansväxt och fästplattan på en alg?

Näringsupptag sker genom rotsystemet till skillnad mot fästplattan som bara är en fästanordning.

Generationsväxling

Se Wikipedia för bra sammanställning av detta.

Ett nytt alternativt sätt som föreslagits för att definiera arter inom Bacteria/Archeae är att använda "average nucleotide identity" (ANI).


Definiera ANI

Sekvenslikheter i gemensamma (genomet?)

Antag att två bakterier har en likhet mellan sina 16S rRNA-gener som är >97% och tillhör alltså samma art. Om vi analyserar dessa bakterier med ANI, kommer ANI vara högre eller lägre än 96%? Motivera.


95-96% ANI motsvarar 98-99% likhet i 16S rRNA-genen. Alltså kommer ANI vara <96% om 16S-likheten <98%

Definitionen på en levande organism är att den består av en eller flera levande celler. Ange tre viktiga förutsättningar som behövs för att en levande cell ska kunna existera.


Energiomsättning (metabolism)


Reproduktionsförmåga


Membran, avgränsning mot omgivningen.

Ange en viktig egenskap som skiljer Thaumarchaeota från de flesta andra Archaea. Finns denna egenskap hos andra prokaryota organismer?

Ammoniumoxiderare (AOA), finns även inom Bacteria (AOB).

Ange en typisk egenskap för gruppen Planctomyces. Namnge och beskriv kortfattat också en grupp inom Plactomyces som har stor betydelse för N-omsättningen på jorden.

- Har många intracellulära membransystem.


- Del av cytoplasman ej kontakt med kromosmen


- Vissa har membran som liknar kärnmembran


- Vissa är anamoxa & har extra membran där energimetabolism sker.

Ammoniumoxiderande & denitrifierande bakterier är grupper av bakterier som definieras av sina respektive energiomsättningssystem. Beskriv kortfattat hur släktskapen ser ut inom dessa två grupper och vad som kan orsakat dessa olika släktskapsmönster.

Denitrifikation = nitrat omvandlas till kvävgas, processen utförs av denitrifikationsbakterier, som utvinner energi ur nitratet.

Genomes can evolve through a variety of mechanisms. One such mechanism is the acquisition of novel genes via horizontal genes via horizontal gene transfer (HGT). Please explain what HGT actually means och describe a specific example of its occurance and consequence in a multicellular organism.

HGT means transfer of genes between organisms/species. Not mothercell to daughter cell.Ex. Tick that sucks blood from one species which red blood cell genes gets transfered to the tick via HGT. A gene that is favorable for the tick and will therefore stay within the species as it makes it a fitter species.

Vad innebär isomorf generationsväxling hos makroskopiska alger?

Att de diploida och haploida stadierna ser likadana ut i generationsväxlingen.

En stor brunalg på flera meter har flera anpassningar för att hålla bålen upprätt för att på så sätt fånga ljus för fotosyntes. Nämn två anpassningar.

Luftfyllda blåsor som ger flytkraft.


Förmåga att absorbera vätska och få en densitet vilken gör den mer flytande i vattenmassan.

Vad är det för skillnad på rotsystemet hos en landväxt och fästplatta hos en alg?

Et rotsystem har funktionen att ta upp vätska/näring till växten. En algs fästplatta är bara en fästanordning och inget med upptag av vatten/näring att göra.

Om två olika latinska binomialer finns för samma ar, hur avgör taxonomer vilket som är korrekt?

Namnet som publicerats först och som är giltigt publicerat enligt den nomenklatoriska kod som är relevant skall användas.

Nämn fyra samband vilka är associerade med hög artbildningshastighet.

Morfologiska skillnader mellan hanar och honor hos fåglar ger högre artbildn.hast. än när könen är lika.


Låg spridningsförmåga.


Dietspecialisering hos insekter.


Pollination hos växter mha djur.

Namnge och redogör kort för minst två naturliga processer som kan leda till topologiska skillnader mellan art- och genträd.

Horisontell genöverföring

Vad är sympatrisk artbildning. Ge ett ex. på en mekanism som kan leda till detta.

Artbildning utan fysiska barriärer.

Beskriv i detalj begreppet heteromorf generationsväxling och vilken är den största grupp som kännetecknas av denna egenskap?

Heteromorf generationsväxling förekommer inom många organismgrupper, t.ex. mossor och fröväxter, och innebär att den haploida och den diploida generationen ser helt olika ut.




Generationsväxling = växling mellan en haploid generation (n) och en diploid generation (2n) hos alger, svampar och växter.



Vad är den fundamentala skillnaden mellan bladen hos en lummerväxt och en mossa?

Lummerväxtens blad är sporofyten och mossans blad är gametofyten.

Till vilken mossgrupp hör en art som har följande egenskaper? Gametofyt med grenar i knippen och blad som består av två typer av celler, dels levande och dels döda. Sporofyten är kortlivad och består endast av en fot och en kapsel.

Vitmossor (Sphagnum)

Förklara i detalj dubbelbefruktning hos blomväxterna (Antophyta) och vilka strukturer processen ger upphov till.

Hanorganet, mikrogamofyten (pollenkornet) består hos angiospermerna av två celler: spermatogen cell och pollenslangscell. Den spermatogena cellen genomgår celldelning så att två spermieceller uppstår. Efter det att pollenslangen vuxit fram till mikropyle ("ingången" till makrogametofyten) befruktar den ena spermiecellen (haploid, n) äggcellen (n) så att den diploida zygoten (2n) bildas. Zygoten bildar sedan växtembryot.

Den andra spermiecellen befruktar de bägge polkärnorna (3n + n) i mitten av makrogamofyten. Denna cell som alltså kommer att ha en pentaploid cellkärna (5n) och kommer att bilda det näringsrika endospermet (frövitan)

Många arter inom den stora gruppen asaterider har tetracykliska blommor. Förklara vad begreppet i detta fall innebär.

Tetra = 4


Fyra omlott placerade strukturer i blomman.

Lökväxter med hypogyna blommor med fria tepaler och 6 ståndare. Frukten är vanligen en kapsel.

Liliaceae

Liliaceae

Örter (sällan vedartade) med motsatta blad utan stipler. Stjälken är vanligtvis 4-kantig. Blomman har ett 4-taligt, undersittande hylle, ståndarna vnaligtvis 4 (sällan 2) till antalet och pistillen består av 2 karpeller vilka utvecklas till en 4-delad klyvfrukt.

Lamiaceae

Lamiaceae