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84 Cards in this Set
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Un inhibiteur compétitif : Influence sur Km , Vmax? |
Ne change pas la Vmax Augmente la Km : réduit l'affinité de l'enzyme pour substrat |
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Un inhibiteur non compétitif : Quel liaison ? Influence km ? Vmax? |
Se lie sur un autre site que site actif mais en ce faisant change la conformation .
Ne change pas la km
Réduit la Vmax |
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qu'est-ce que l'electrophorese ? |
Déplacement d'ions sous l'effet d'un champ électrique Séparation et caractérisation de molécule d'ions en fonction de leur taille, et charge jusqu'a ce qu'ils atteignent leur point isoelectrique |
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Dans electrophorese Qui migrent vers anode ? Vers cathode. ? |
Les anions vers anodes Les cations vers cathodes |
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Les voies cataboliques:
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Dégradations Oxydatives(donne des e) Fournit énergie Les voies sont convergentes Utilisent NAD+ et FAD comme porteurs(accepteur) d'électrons |
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Voie anaboliques: |
Biosynthese. Reductrice (besoin de e) Nécessité énergie Les voies sont divergentes Utilisent NADPH comme donneur d'électrons |
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Qu'est-ce que la Km ? Que signifie une Km basse /élevé? |
Concentration de substrat a laquelle l'enzyme est a demi saturation Km bas: haute affinité et faible capacité Km haut: faible affinité et haute capacité |
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Qu'est-ce que la vmax? |
Vitesse de réaction a laquelle l'enzyme est a saturation |
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Qui de l'hexokinase ou glucokinase est un senseur de la glycémie ? Pourquoi ? Hexokinase dans cerveau , affinité 0.05mM pour glucose Glucokinase dans foie , affinité 20mM pour glucose |
La glucokinase car avec son km élevé elle peut sentir les changements de glucose . Contrairement a hexokinase qui avec sa km basse est toujours a saturation a glycémie normale |
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Les enzymes allosteriques caractérisés par une courbe sigmoide: vitesse accélère avant K0.5 puis ralenti brutalement après -la fixation du substrat sur l'enzyme augmente l'affinité de l'enzyme pour le substrat : cooperatif Elles peuvent être regules par ? |
Effecteur négatif (inhibiteur ): Augmente K0.5 Effecteur positif (activateur) : Diminue K0.5 |
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La réaction limitante : ? |
C'est l'étape régulatrice au début de la chaine de réactions. C'est une réaction spécifique et irréversible pour forcer les autres réactions en aval |
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La vitesse de réaction dépend de ? |
-Disponibilité du substrat -Activité de l'enzyme -concentration de l'enzyme |
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La disponibilité du substrat dépend de ? |
1-Approvisionnement en précurseur A et flux métabolique
2-competition avec une éventuelle autre réaction
3-Approvisionnement en coenzyme
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L'activité d'une enzyme peut être activer /contrôler par ? |
1) activer par proteolyse (irréversible) 2) activer par fixation d'une protéine de contrôle (réversible) 3) contrôler par phosphorylation/dephosphorylation (réversible) 4) contrôle allosteriques (réversible) |
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La phosphorylarion se fait par une ? La dephosphorylation par ? |
Kinase Phosphatase |
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On peut faire régulation métabolique par 3 moyens que sont-ils et qu'elles sont leur particularités? |
1) contrôle allosterique: régulation locale,réponse immédiate 2) contrôle par modification covalente : régulation physiologique, organisme, réponse moyen terme, permet amplification du signal hormonal 3) Contrôle transcriptionnel: régulation adaptation , cellulaire ou organisme, réponse a long terme , permet l'economie des ressources |
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Que sont les coenzyme ? A quoi servent -elles ? |
-Indispensable a l'activité de certaines enzyme -Ne sont pas des protéines -retrouvent leur état initial après réaction -participe a la stœchiométrie de la réaction -Souvent des vitamines |
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Qu'est-ce qu'une enzyme ? |
-une protéine -catalyseur biologique de réactions biochimique -Augmente la vitesse de réaction en diminuant l'énergie d'activation -est spécifique a son substrat -ne change pas la keq -est regulable |
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Quels sont les cosubstrat? Quel est leur particularité ? |
Coenzyme pyridinique NAD et NADP Libre, pas lie a l'enzyme , agissent comme substrat. Participent a 2 réactions couplé: 1-prise en charge (e, atomes, molécules ) 2-Transfert |
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Quels sont les groupes prosthetique? Quel est leur particularité ? |
Coenzyme flavinique :FAD, et FMN Fixé de façon covalente a l'enzyme et ne la quitte pas jusqu'à la dégradation Double réaction en 1 seule opération : prise en charge et transfert (e, atomes, molécules ) |
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Quel sont les fonctions des coenzymes? 2 types de coenzymes ? |
Transfert par prise en charge transitoire d'une molécule a l'autre de électrons , atomes, molécules Oxydoreduction + transfert Cosubstrat / groupe prosthetique |
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Quels sont les coenzymes pyridinique ? De quelle vitamine sont-elles dérivée? |
NAD et NADP Dérivé de vitamine B3 ,niacine (Une carence en B3: pellagre: dermatite, diarrhée , démence )
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Quelles sont les coenzymes flavinique ? De quelle vitamines dérivé? |
FAD et FMN Dérivé de vitamine B12 et B2, riboflavine (Une carence en B2 provoque fissure au coin des lèvres ) |
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NAD : processus dans réactions cataboliques ? |
1) NAD+ est un oxydant qui accepte les électrons
En acceptant devient réduit
2) NADH est un réducteur qui transfert ses électrons a la chaine respiratoire |
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NADP : processus dans réactions anaboliques ? |
Agit principalement comme réducteur : NADPH Il donne ses électron dans les réactions anaboliques |
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FAD : Formé de ? Dérivé de ? Localisé dans ? Processus dans réactions catabolisme ? |
FMN et AMP Riboflavine Dans mitochondrie FAD oxydant accepte électrons . Se réduit en FADH2. FADH2 transfert ses e a la chaine respiratoire |
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La première réaction avec le glucose quand il rentre dans la cellule est de ? |
Phosphoryler le glucose en glucose 6-phosphate |
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Le glucose 6 phosphate peut prendre 3 voies lesquelles ? |
-Voie des pentoses: ribose 5P -dépôt: glycogene -Glycolyse : piruvate |
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La Glycolyse : Ou se passe-t-elle ? Quel est le but ? Qui est l'accepteur d'équivalent réducteur ? Consommation d'oxygène ? |
-Dans le cytoplasme -Fournir des metabolites et précurseurs , ATP -NAD+ -non : anaerobique |
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La glycolyse peut être subdivisé en 2 étapes : comment s'appellent elles ?
Quelle est l'étapes limitante ? Quel est le bilan énergétique ? |
1ere phase : phase d'investissement : on a besoin d'1 ATP pour phosphoryler le glucose en glucose 6P. Puis d'un autre ATP pour phosphoryler le fructose 6P en fructose 1.6 diphosphate
2eme phase : retour sur investissement : On gagne 2× 2ATP :énergie directe Et 2 NADH: énergie indirecte
Bilan : 2ATP,2NADH, 2 pyruvates |
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Le pyruvates peut prendre plusieurs voies differentes en fonction de la cellule dans laquelle il est et si anaerobique ou aerobique Quelles sont elle ? Bilan ? |
Anaerobe : voie de fermentation lactique avec bilan 2ATP
Aerobie: dans mitochondrie cycle de l'acide citrique Bilan : 38 ATP si navette malate/ aspartate 36 ATP si navette glycerophosphate |
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Quele sont les différence entre hexokinase et glucokinase ? |
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Dans la glycolyse en condition Aerobie le NADH est reoxyde en NAD+ avec la navette glycerophosphate qu'est-ce qu'on obtient au finale ? |
1 FADH2 génère 2 ATP |
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Dans la glycolyse en condition Aerobie a la fin le NADH peut être reoxyde en NAD+. Avec la navette malate /aspartate qu'est-ce qu'on obtient en bout de chaine ? |
1 NADH génère 3 ATP |
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Le cycle de Krebs: Ou ? Fournit % de l'énergie cellulaire A partir de quoi ? Quels sont les accepteur d'equivalent reducteurs? |
Dans la mitochondrie, dans toutes cellules sauf GR Fournit 90% de l'énergie cellulaire Acetyl CoA NAD+ et FAD |
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L'Acetyl- CoA peut provenir de plusieurs origines? |
Glucose : pyruvate > AcetylCoA Lipides: acides gras forment Acetylcoa forment Acetylcoa Protéines : aa peuvent former pyruvate , ou AcetylCoA ou entrer directement dans cycle de Krebs |
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La vitesse du cycle de Krebs dépende de? |
La fourniture d'Acetyl coa |
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L'activité du cycle de Krebs dépend de ? |
Disponibilité des coenzymes : NAD+ et CoA |
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Le flux d'entrée de AcetylCoA dans cycle a partir du pyruvate est régule par? Comment ? |
Pyruvate deshydrogenase (PDH) PDH phosphoryler = inactive PDH dephosphoryler = active |
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Dans le cycle de Krebs :
Combien de réactions au total? Combien de réactions d'Oxydoreduction ?
Quels sont les 3 réactions irréversible et limitante qui règlent la vitesse du cycle ? |
8 dont 4 réactions d'Oxydoreduction ( 3 NADH /1 FADH2)
Citrate synthase Isocitrate-DH a-Cetoglutarate-DH |
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L'anaplerose (réapprovisionnement du cycle de Krebs) est assuré essentiellement par ? |
Pyruvate carboxylase = voie anaplerotique |
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Quel est le bilan énergétique du cycle de Krebs ? |
Production de 11 ATP par equivalent réducteur Et production de 1 ATP a partir d'1 GTP 12 ATP |
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La chaine respiratoire : Combien de complexe ? Quel fonction ? Quels sont les transporteur mobiles d"électrons ? |
5 complexes : 4 fixes (1;2;3;4) -Complexe 1,3,4 : pompes a protons -Complexe 2: enzyme du cycle de Krebs - succinate- fait le lien entre cycle et chaine respiratoire -Complexe 5: synthèse d'ATP a partir d'ADP +Pi en dissipant le gradient de protons - ATP synthase Coenzyme Q et cytochrome C |
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Bilan du catsbolisme oxydatif Aerobie? |
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Qui sont les 2 plus gros consommateurs de lipides ? |
Tissus adipeux Muscle |
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Stockage des lipides ? |
Il n'y a pas de limite de stockage de lipide Dans tissus adipeux sous forme de triglycerides Le foie chez l'homme n'a pas de fonction de stockage chez homme |
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Qu'est-ce qu'un acide gras ? |
Acide carboxylique avec une chaine de 4 a 36 carbones |
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Qu'est-ce qu'un acide gras insaturés ? Quel propriété? |
Présence de double liaisons = encore de la place pour électrons Chez insaturés cis (origine végétale huile ): point de fusion + bas Chez insaturés trans (origine industrielle margarine) : point de fusion + haut |
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Qu"est-ce qu"un acide gras saturés? Propriété? Exemple ? |
Pas de double liaison Origine animale (beurre) : Point de fusion +haut Acide palmitique C16 |
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Quels sont les acides gras essentiels ? |
Acide gras insaturés: Omega 3 : acide linolenique Omega 6 : acide linoléique |
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L'ADN est composé de ? |
-De sucre : desoxyribose -4 bases : Purines : Adinine/Guanine Pyrimidine : Cytosine/ Thymine/ Uracil (arn) -Phosphate |
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Qu'est-ce qu'un nucleoside ? |
Base + sucre |
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Qu'est-ce qu'un nucleotide? |
Base+sucre+phosphate
Base fixe sur Carbone 1 Phosphate fixe sur Carbone 5 |
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Polarite de l'ADN ? |
5' - 3' Le phosphate fixe sur carbone 5 va se lier au carbone 3 de la base suivante |
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Complémentarité des 2 brins : Les bases se lient? |
A=T G=C Donc autant de A que de T et de G que de C dans une espèce Le rapport A+T/ G+C est typique pour chaque espèce |
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Les ponts d'hydrogène assurent la complémentarité entre les bases . Combien de pont entre AT Combien entre GC |
A=T : 2 ponts d'hydrogene G=C : 3 ponts d'hydrogene |
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Double helice d'ADN : Plusieurs types lesquels ? |
Type B : dextrogiant +répandu , ADN physiologique Type Z : levogire, lorsque contrainte trop grande lorsque on ouvre l'ADN donc superenroulement et devient Z (enroule a Gauche) Type A : forme aplatie peut être la signature d'une liaison d'une protéine a l'ADN |
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On peut dénaturer ou renaturer 2 brins d'ADN : Comment ? La vitesse dépend ? |
Température ou agent chimique (NaOH) peuvent séparer 2 brins Température de dénaturation dépend de la longueur et du contenu de l'ADN +dur et +long de dénaturer une séquence ou il y a beaucoup de G=C |
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On peut déterminer si changement dans séquence ADN avec ? |
Hybridation |
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Que permet l'analyse de Southern? De northern? Western ? |
Southern : permet l'analyse de l'ADN via un transfert d'ADN Northern : analyse ARN Western : analyse proteine |
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Qu'est-ce que les enzymes de restrictions ? Comment déterminer combien de segment pour une enzyme qui reconnaît une séquence de "n" nucléotides ? |
Protéines qui reconnaissent des séquences spécifiques et coupent l'ADN sur les 2 brins (1/4)^n |
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Une manière de protéger son ADN contre les enzymes de restriction est de? Est-ce une modification héréditaire ou epigenetique? |
Methylation de certaines bases de l'ADN au site de reconnaissance de l'enzyme de restriction Modification epigenetique |
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L'acetyl coa peut provenir du métabolisme lipidique et plus précisément de ? |
- a partir des TG -La bêta oxydation d'AG produit son nombre de C/2 d'acetyl coa -Corps cetonique en période de jeune |
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La bêta oxydation est une voie ? Ou se passe -telle ? |
-Du catabolisme oxydatif, aerobie des acides gras -essentiellement mitochondrial |
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Différentes étapes de la bêta -oxydation ? |
Avant il faut faire cet acetyl coa : 1 ATP est consommé pour que AG se lie a un CoA grâce a acylcoa synthetase. Cette réaction a lieu dans le cytosol. 1) la membrane interne mitochondrial étant imperméable aux Acyl- Coa, la navette de la carnitine prend en charge l'Acyle et libère le Coa. Puis le groupement entre dans la mitochondrie , et l'Acyl est confie a un CoA mitochondrial et libere carnitine. 3) 4 réactions : -deshydratation (FAD > FADH2) -hydratation -Déshydratation (NAD+ > NADH) -Clivage entre atome de carbone a et b de l'Acyl 4) pour les acides gras insatures il faut 2 enzymes supplémentaire pour passer l'obstacle des doubles liaisons : isomerase et reductase |
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Quel est le point de régulation de la bêta oxydation ? Par quoi est-ce régulé? |
carnitine Acyle transferase 1 Lorsque situation de penurie , mitochondrie est desenergisee et riche en NAD+ , FAD, CoA-SH: la bêta oxydation alimente le cycle de l'acide citrique Lorsque situation de pléthore et mitochondrie energisee avec plein de NADH, FADH2, Acetyl- CoA: inibition de cette carnitine transferase 1 par la malonyl-CoA pour faire de l'élongation. Lorsque |
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Que se passe-t-il a chaque tour de la bêta oxydation ? Quel est le résultat final ? |
A chaque tour il y a rsccourcisement de 2 carbone et production de 1 NADH et 1 FADH2 A la fin on obtient C/2 molécules d'acetyl-Coa |
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Que devient l'Acetyl CoA produit par la bêta -oxydation ? |
- oxydé en CO2 et H2O par le cycle de l'acide citrique -précurseur de molécules d'intérêt biologique : cholestérol et isoprenoides -Substrat de la cetogenese hépatique en période de jeune |
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Quel est le bilan énergétique de la bêta oxydation pour un C16, et avec cycle de krebs? |
- 35 ATP -35+96 -1 = 130 ATP |
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Qu'est-ce que le quotient respiratoire ? |
Le rapport entre la quantité de carbone oxyde en CO2 et la quantité d'O2 nécessaire a ce catabolisme . Il nous indique le type de substrat consommé. QR glucose: 1 QR acide gras : 0.7 |
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La synthèse des acides gras : Favorisé quand ? Dépend principalement de ? Stimulé par ? |
-En période de pléthore -disponibilité en substrat d'origine glucidique - insuline |
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La synthèse des acides gras se fait par 3 mécanisme lesquels ? |
- la synthèse cytosolique ou voie de Wakil a partir de l'acetyl-CoA jusqu'au C16 (palmitate) -L'élongation mitochondrial allongent au delà de C16 -l'élongation et la dénaturation microsomale forment les acides gras insatures |
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La synthèse cytosolique : Endergonique ou exergonique? Oxydative ou reductrice? Quels sont les substrats du Palmitoyl- CoA? Origine de Acetyl- CoA? |
-Endergonique et reductrice -Acetyl-CoA, ATP , NADPH - Acetyl-CoA provient de la glycolise ou du catabolisme des aa. L'Acetyl- CoA produit dans la mitochondrie est transférée dans le cytosol par la navette du citrate |
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L'acetyl-CoA pour faire synthèse des AG doit rejoindre le cytosol grâce a la navette du citrate: se transfert se fait en 2 réactions lesquelles ? |
1) dans mitochondrie : condensation de l'Acetyl- CoA et de l'oxaloacetate pour former le citrate , réaction catalysée par la citrate synthase Puis ce citrate traverse membrane grâce au transporteur des acides tricsrboxyliques
2) dans le cytosol : la citrate lyase clive le citrate en Acetyl- CoA et en oxaloacetate |
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La synthèse cytosolique de AG : 2 étapes ? |
1)Carboxylation de l'acetyl- CoA (2C) en malonyl- CoA (3C) Par l'enzyme acetyl-CoA carboxylase. (Active sous forme dephosphorylee) Consomme 1 ATP, réaction irréversible, limitante 2) cycle formant le C16 par la multienzyme: acide gras synthetase . 4 réactions . amorce Acetyl-CoA Une fois que C16, la palmityl thiosterase libère l'acide palmitique. Une fois active en Palmitoyl-CoA, empreinte la navette de la carnitine pour rentrer dans mitochondrie et subir réaction d'élongation |
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L'élongation mitochondrial de AG : |
Palmitoyl-CoA est transfère dans mitochondrie par navette carnitine . L'élongation est une simple réversion de la Bêta-oxydation sauf pour la dernière réaction ou le NADPH remplace le FAD. Se fait en condition de plethore |
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L'étape limitante de la synthèse des AG est ? Qui la contrôle ? |
L'acetyl-Coa carboxylase qui transforme l'acetyl-Coa en malonyl- coa (Si trop de palmitoyl- CoA alors inibition de l'ACC et donc pas de malonyl-Coa produit donc levée d'inhibition de la navette de carnitine et donc palmitoyl -CoA entre dans mitochondrie energisee ou elle pourra être allongée ) |
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Quelles sont les principale différence entre synthèse et bêta oxydation des AG ? |
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Un triglycerides est composé de ? |
Esters d'acide gras + glycérol |
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Les TG sont la forme de ...,....et...des AG |
D'apport alimentaire Transport plasmatique Stockage intracellulaire |
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Pourquoi les acides gras sous la forme de triglycerides sont la forme privilégiées de réserve énergétique ? |
- + réduit que les glucides -anhydres:ils sont hydrophob |
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La synthèse des TG a besoin de 2 substrats préalablement ....? |
Acides gras et glycérol sous forme active : acetyl -CoA + glycerol 3 phosphate |
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Le catabolisme des triglycerides en AG et glycerol est cataboliseé par 3 enzymes tissu spécifique lesquelles ? |
-Lipase pancréatique : hydrolyse les TG dans la lumière intestinale pour qu'ils puissent passer la membrane -lipoproteine Lipase : dans la circulation sanguine libère les AG transporte sous forme de TG par les lipoproteine. Présente a la surface de l'endothelium capillaire . -Lipase cellulaire : hormonosensible. Agite dans les c qui mobilisent des stocks de TG La Lipase hépatique n'est pas hormonosensible ! |
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Le fructose: Métaboliser ou ?Grâce a ? Il induit quoi ? Il diminue quoi ? |
-dans le foie par la fructokinase. - induit la synthé de lipide hépatique. + favorise steatose hépatique et résistance a l'insuline. -diminue activité hépatique des facteurs de transcription qui contrôle la b-oxydation des lipides . -ne stimule pas la sécrétion d'insuline donc pas de sentiment de satiété: ...corrélation avec obésité |
