ביולוגיה של התא - 2

Front 1

מה מבנה המיקרוטובולי?

Back 1

דימרים של תת יחידות אלפא (-) ובטא (+) יוצרים פרוטופילמנט. 13 פרוטופילמנטים מקבילים יוצרים סיב חלול בקוטר 25nm.

Front 2

כיצד נבנה המיקרוטיובולי?

Back 2

מרבית המיקרוטובולי מניצים מ-MTOC, כמו צנטרוזום או גופים באזליים (ב-cilia וב-flagella). הוא מכיל את ה-γ-tubulin ring complex המשמש כפיגום לתחילת פילמור הסיב ע"י דימרים של α/β-tubulin מהקצה ה-(-) לקצה ה-(+).

הסיב עצמו נמצא במצב של dynamic instability, כלומר, כל הזמן הוא מתארך ומתקצר מהקצה ה-(+). גם תת יחידה אלפא וגם תת יחידה בטא קושרות GTP. בתת יחידה אלפא ה-GTP משמש בתפקיד מבני בעוד שבתת יחידה בטא הוא יכול לעבור הידרוליזה ל-GDP ולהקטין את האפיניות של הסיב לדימרים. פילמור מהיר -> GTP-cap שמייצב את המולקולה.

Front 3

Capping proteins

Back 3

נקשרים לקצה ה-(+) של המיקרוטובולי ומונעים דה-פולימריזציה שלו.

Front 4

סוגי המטען (cargo) של המיקרוטובולי

Back 4

1. חלבונים
2. ואסיקולות
3. אורגנלות

Front 5

מה כיוון התנועה של קינזין על מיקרוטובולי?

Back 5

מה-(-) ל-(+), חוץ מקינזין 14.

Front 6

מה כיוון התנועה של דינאין על מיקרוטובולי?

Back 6

מה-(+) ל-(-).

Front 7

כיצד נעים חלבוני המנוע קינזין ודיאנין על סיב המיקרוטובולי?

Back 7

ה-motor heads נעים על סיב המיקרוטובולי ע"י הידרוליזה של ATP-> ADP + pi שגורמת לשינוי קונפורמציה. ה-tail נושא את המטען.

Front 8

קוהזין

Back 8

חלבון בצורת טבעת המצמיד את הכרומטידות האחיות.

Front 9

קונדנסין

Back 9

חלבון בצורת טבעת אשר אחראי על דחיסת הדנ"א במיטוזה.

Front 10

שלושת סוגי המיקרוטובולי במיטוזה

Back 10

1. aster micritobules
2. interpolar micritobules
3. kinetochore micritobules

Front 11

מה תפקיד הדיאנין בזמן המיטוזה?

Back 11

הוא קושר את הממברנה הפלזמטית כמטען ונע לכיוון הקצה ה-(-) של המיקרוטובולי. כיוון שהממברנה קבועה במקום הוא למעשה מקרב את הצנטרוזום לממברנה.

Front 12

separase

Back 12

בתחילת האנאפזה separase מפרק את הקוהזין ומאפשר את הפרדת הכרומטידות האחיות.

Front 13

securin

Back 13

לפני תחילת האנאפזאה האנזים separase מעוכב ע"י קישור לחלבון securin. כשכל הקינטוקורים נמצאים במצב יציב ומחוברים נכון, ה- Anaphase Promoting Complex - APC/C
מאוקטב. יש לו פעילות של E3 ubiquitin ligase שמזהה ונקשרת ל-securin מה ששולח אותו לפירוק בפרוטאוזום ומפעיל את ה-separase.

Front 14

פרוטאוזום

Back 14

קומפלקס חלבונים בעל יחידה קטליטית שמפרקת חלבונים לפפטידים קצרים ושתי יחידות רגולטוריות שמזהות ומכניסות רק חלבונים עם multiubiquitin chain. הסמן נקשר ליחידה הרגולטורית ונחתך. יש מיחזור שלו.

Front 15

מה הם שני שלבי האנפאזה?

Back 15

1. אנפאזה A - כרומטידות אחיות נפרדות בגלל התקצרות של ה-kinetochore micritobules בשני הכיוונים. אין הפרדה של הקטבים.
2. אנפאזה B - הפרדה של ה-mitotic poles בגלל התארכות של ה-interpolar micritobules.

Front 16

Nocodazol

Back 16

משמש בכימותרפיה. קושר תת יחידות של מיקרוטובולי ולכן מעכב פולימריזציה של הסיב. מונע התארכות של ה-interpolar micritobules ולכן התא לא מצליח להתחלק.

Front 17

Taxol

Back 17

משמש בכימותרפיה. מייצב מיקרוטובולי ולכן מונע דה-פולימריזציה של הסיב. מונע התקצרות של ה-kinetochore micritobules ולכן פוגע בחלוקת התא.

Front 18

כיצד נוצרת מעטפת הגרעין מחדש בטלופזה

Back 18

דה-פוספורילציה של תת היחידות של הלמינה והרכבה ספונטנית שלהם מחדש.

Front 19

גמטה

Back 19

תא מין. מספר הפלואידי של כרומוזומים.

Front 20

זיגוטה

Back 20

ביצית מופרית. מספר דיפלואידי של כרומוזומים.

Front 21

Gain of function mutation

Back 21

דומיננטית

Front 22

Loss of function mutation

Back 22

כמעט תמיד רצסיבית

Front 23

ללא רקומבינציה הומולוגית, כמה סוגי גמטות יכולות היו להיווצר?

Back 23

2^n
n=מספר זוגות כרומוזומים הומולוגים

Front 24

Synaptonemal complex

Back 24

קומפלקס חלבוני שנוצר בפרופאזה 1 של המיוזה ונועד לקשור בין כרומוזומים הומולוגים לצורך זיווגם כביוולנט ויצירת סינפסה. השלבים ביצירת הקומפלקס: לפטוטן, זיגוטן, פכיטן, דיפלוטן, דיאקינזיס.

Front 25

Interphase 2 / Interkinesis

Back 25

זמן מנוחה בין מיוזה 1 למיוזה 2.

Front 26

מה ההבדל בין פרופאזה ופרומטאפזה 1 ובין פרופאזה ופרומטאפזה 2 במיוזה?

Back 26

פרופאזה 1 - צימוד הומולוגים ורקומבינציה גנטית.
פרומטאפזה 1 - פירוק מעטפת הגרעין ותנועה של ההומולוגים לעבר מישור החלוקה.

פרופאזה 2 - דחיסת כרומטידות אחיות. פרומטאפזה 1 - פירוק מעטפת הגרעין ותנועה של הכרומטידות לעבר מישור החלוקה.

Front 27

ההבדל בתוצר הסופי בין מיטוזה למיוזה

Back 27

מיטוזה - 2 תאי בת זהים גנטית.
מיוזה - 4 תאי בת שונים גנטית.

Front 28

Homogenization

Back 28

שיטה לפרק את הממברנה תוך השארת האברונים שלמים (בניגוד לסוניפיקציה ו-detergent lysis) ע"י בוכנה מסתובבת. התוצר הסופי נקרא הומוגנאט.

Front 29

Pellet

Back 29

המשקע שנותר לאחר צנטריפוגה (הנוזל שמעליו נקרא supernatant).

Front 30

צנטריפוגה דיפרנציאלית

Back 30

צנטריפוגה בשלבים במהירות שהולכת וגדלה.

Front 31

Equilibrium gradient centrifugation

Back 31

Isopycnic density gradient centrifugation

Front 32

2 סוגי ה-ER

Back 32

1. Smooth ER
2. Rough ER - שם מתבצע התרגום

Front 33

SRP

Back 33

קומפלקס חלבוני שאחראי להוביל ריבוזות שמתרגם חלבון עם פפטיד סיגנל לתעלת הטרנסלוקציה שם הוא נקשר לרצפטור ל-SRP ומתנתק תוך השקעת אנרגיה (הידרוליזה של GTP).
מכיל: translational pause domain, structural RNA molecule, signal sequence binding pocket, GTPase & SRP recoptor binding site.

Front 34

חלבון ממברנאלי type 1

Back 34

מכיל signal sequence בקצה האמיני ו-stop transfer sequence (רצף הידרופובי) באמצע כך שהקצה האמיני של החלבון נמצא בתוך ה-ER lumen והקצה הקרבוקסילי בחוץ.

Front 35

חלבון ממברנאלי type 2

Back 35

מכיל start transfer sequence במרכז החלבון וללא stop transfer sequence כך שהקצה הקרבוקסילי של החלבון נמצא בתוך ה-ER lumen והקצה האמיני בחוץ.

Front 36

double pass membrane protein

Back 36

מכיל start transfer sequence במרכז החלבון ומתורגם עד ה-stop transfer sequence כך שגם הקצה האמיני וגם הקצה הקרבוקסילי של החלבון נמצאים בחוץ.

Front 37

Multi pass membrane protein

Back 37

מכיל כמה אזורים בעלי signal sequence ו-stop transfer sequence כך שנכנס ויוצא מהממברנה לסירוגין.
נקרא גם polytopic protein.

Front 38

אילו מודיפיקציות פוסט תרגומיות עוברים החלבונים המופרשים ב-ER

Back 38

1. קיפול נכון ובקרת איכות
2. יצירת קשרי S-S
3. הוספה קוולנטית של סוכר (גליקוליזציה) -> גליקופרוטאין
4. הרכבה של חלבונים מולטימרים

Front 39

איזה חלבון מגן על החלבונים מפני קיפול לא נכון ע"י קשירה לאזורים הידרופוביים? מדוע?

Back 39

צ'פרון. מונע אגרגציה של אזורים הידרופוביים בזמן הסינתזה.

Front 40

מה עשוי לגרום לקיפול לא נכון של החלבון?

Back 40

point mutation
אין די שפרונים

Front 41

protein disolfide isomerase (PDI)

Back 41

אנזים בעל 2 קבוצות sulfhydryl שיכול:
1. לחמצן חלבון מחוזר, ליצירת קשר S-S (האנזים מתחיל במצב מחומצן והופך למחוזר).
2. איזומרציה של קשרי S-S לא נכונים (האנזים מתחיל במצב מחוזר).

Front 42

N-linked glycosylyation

Back 42

ב-ER. הוספת N-אצטיל גלוקוזאמין (נגזרת של גלוקוז עם קבוצת N-אצטיל על פחמן 2 במקום OH) על הקבוצה האמינית בשייר של Asn בתוך קונטקסט של אתר גליקוזילציה מסוג N. ההוספה עשויה להיות של N-אצטיל גלוקוזאמין לבד או עם עוד סוכרים שקשורים אליו => מתקבל N-linked glycoprotein.

Front 43

O-linked glycosylation

Back 43

בציטוזול (הוספת יחידה אחת של N אצטיל גלוקוזאמין) ובגולג'י (הוספת סוכרים אחרים). גליקוזילציה על שיירי Ser או Thr.

Front 44

האם N אצטיל גלוקוזמין יכול להיקשר בקשר O-linked לחלבון הפרשה?

Back 44

אך ורק על חלבון ממבראנאלי על החלק החוץ ממברנאלי שבא במגע עם הציטוזול ואך ורק יחידה אחת.

Front 45

האם חלבונים ציטוזוליים/גרעיניים יכולים לעבור גליקוזילציה?

Back 45

אך ורק של תוספת N אצטיל גלוקטזמין אחד בקשר O-linked. כל יתר סוגי הגליקוזילציות הם על חלבוני הפרשה (כולל חלבונים ממברנאליים).

Front 46

אתר גליקוזילציה מסוג N

Back 46

Asn-X-Ser/Thr
X - כל חומצה אמינית חוץ מפרולין

Front 47

כיצד נוצרים פוליסכרידים?

Back 47

1. הפעלת סוכר ע"י חיבורו ל- UDP בתגובת קונדנסציה:
sugar-OH + UTP -> sugar-o-udp + H2O + Pi
2. הוספת סוכר לשרשרת סוכרים תתבצע תוך שחרור UDP.

הקישור יכול להיות לכל קבוצת OH ולא חייב להיות לינארי.

Front 48

מה המנגנון של הוספת מונו/אוליגוסכריד ב-ER (גליקוליזציה מסוג N)?

Back 48

שרשרת סכרידים נבנית על dolichol diphosphate, ליפיד שנעוץ בממברנת ה-ER מצידה הלומינלי. ומשם עוברת לחלבון על אתר גליקוליזציה מסוג N.

Front 49

unfolded protein response

Back 49

כאשר יש הרבה חלבונים שהם misfolded (כתוצאה ממוטציה, תנאים דהנטורטיבים ועוד) הם מצטברים ואין מספיק שפרונים/מערכות דגרדציה לטפל בהם. נוצר ER stress. יש רצפטורים ממברנאליים בצד הפנימי של ה-ER שמסוגלים לקשור חלבון שהוא misfolded -> מוביל ל-unfolded protein response שגורמת ליצירת עוד שפרונים (מתורגמים לתוך ה-ER) ועוד פרוטאוזומים.

Front 50

smooth ER

Back 50

שם מתרחשת סינתזה של ליפידים, פוספוליפידים וסטרואידים. מכילה את מאגר הסידן של התא (בנוסף למיטוכונדריה).

Front 51

sarcoplasmic reticulum

Back 51

ה-smooth ER במיוציטים (תאי שריר). שואבת +Ca2 מהציטוזול, מאחסנת אותו ומשחררת אותו כשיש סטימולציה של שריר.

Front 52

secretion pathway

Back 52

ה-ER -> גולג'י -> אורגנלות/ממברנה פלזמטית/ECM

Front 53

Golgy stack

Back 53

אפרטוס גולג'י. נקרא כך כי נראה כמו ערמת צלחות אחת על השניה.

Front 54

מה תפקיד הגולג'י?

Back 54

עיבוד הסכרידים שהוספו ב-ER על הגליקופרוטאינים ובפרט: זרחונם, הורדת רוב הסכרידים על השרשרת מסוג מאנוז (high mannose type->complex type), הוספת מונוסכרידים נוספים עם/בלי הסתעפויות ולרוב, הוספת חומצה ציאלית בסוף השרשרת (N acetylneuraminic acid=NANA). סוכר עם ראש קרבוקסילי שטעון שלילי ב-PH פיזיולוגי.
ה-complex type olygosacharid מכתיב את יעדו הסופי של הגליקופרוטין.

Front 55

גולג'י - cis face

Back 55

משם נכנסים חלבוני ההפרשה שמגיעים מה-ER.

Front 56

גולג'י - trans face

Back 56

משם יוצאים חלבוני ההפרשה.

Front 57

CGN

Back 57

cis golgy network=ER to golgy intermedial compartment (ERGIC)=
vasiculo-tubular clusters (VTC)

שם מתרחש sorting וזרחון סוכרים על הגליקופרוטאינים.

Front 58

צלחת cis

Back 58

שם מתרחשת הסרת רוב יחידות המאנוז.

Front 59

צלחת medial

Back 59

שם מתרחשת הוספת GlcNAC.

Front 60

צלחת trans

Back 60

שם מתרחשת הוספת גלקטוז ו-NANA.

Front 61

TGN

Back 61

שם מתרחשת הוספת גופרית+sorting.

Front 62

COP2

Back 62

ציפוי לואסיקולות מה-ER לגולג'י.

Front 63

COP1

Back 63

ציפוי לואסיקולות שחוזרות מהגולג'י ל-ER.
KDEL (Lys-Asp-Glu-Leu) endoplasmic reticulum protein retention receptor 1.

Front 64

קלטרין

Back 64

ציפוי לואסיקולות שנכנסות מהממברנה הפלזמטית לפנים התא ומהגולג'י לאורגנלות השונות.

Front 65

cargo receptors

Back 65

קושרים חלבונים על מנת שיוכלו להיכנס לואסיקולה על מנת להנץ מהממברנה.

Front 66

ER exit site

Back 66

שם מצטברים ה-cargo receptors ומנצים משם.

Front 67

Sar-GDP

Back 67

משתתף ביצירת ואסיקולות מסוג COP2. נקשר לחלבון ממברנאלי באזור ה-ER exit site של הואסיקולה שגורם לשחלוף GDP ב-GTP. כשהואסיקולה מתקרבת לגולג'י Sar-GTP עובר הידרוליזה לSar-GDP וגורם ל-uncoaring של הכיסוי. מתקבלת naked vesicle שעוברת עגינה לממברנת הגולג'י ע"י חלבוני SNARE.