ביולוגיה של התא - חמוטל - שיעורים 1-8 - Gre

Front 1

איפה נלמד רפואה???????

Back 1

Front 2

ממה מורכבת ממברנת התא?

Back 2

ממברנת התא מורכבת מפוספוליפידים, ספינגוליפידים וכולסטרול.

Front 3

מהם ארבעת החומרים החומרים הנפוצים ביותר בגוף האדם?

Back 3

Front 4

מהם ארבעת הקשרים הכימיים הידועים?

Back 4

1. קשר קוולנטי

2. קשרי מימן

3. קשר יוני

4. קשרי ואן-דר-ואלס (V.D.V)

Front 5

סדר את ארבעת הקשרים מהחזק ביותר לחלש ביותר.

Back 5

החזק ביותר - קשר קוולנטי

קשר יוני

קשרי מימן

החלש ביותר קשרי VDV (קשרים הידרופוביים)

Front 6

איזה אלמנטים צריך ליצירת קשרי מימן?

Back 6

אטום NOF שקשור למימן ועוד אטום NOF במולקולה אחרת.

Front 7

מה זה Tm של DNA?

Back 7

הטמפרטורה בה חצי מגדיל הDNA עבר דנטורציה (ממצב של דו גדיל לחד גדיל).

Front 8

אילו זיווגי בסיסים חזקים יותר? A-T או G-C?

Back 8

G-C

מכיוון שיש בינהם 3 קשרי מימן.

Front 9

מה הנוסחא הבסיסית של פחמימות?

Back 9

Front 10

מיהו הסוכר הקטן ביותר?

Back 10

גליצראלדהיד

Front 11

מה ההבדל בין קונפיגורציה D ל-L?

Back 11

שתי מרכזים כיראליים (אטום פחמן המחובר לארבע קבוצות שונות) המהווים תמונת מראה אחת של השניה.

קונפורמציית D - החומר מסובב אור מקוטב ימינה.

קונפורמציית L - החומר מסובב אור מקוטב שמאלה.

Front 12

מה ההבדל בין אלדוז לקטוז?

Back 12

אלדוז - הקרבוקסיל נמצא בפחמן הראשון ויוצר אלדהיד.

קטוז - הקבוקסיל נמצא בפחמן השני ויוצר קטון.

Front 13

מתי גלוקוז יהיה בצורה טבעתית ומתי בצורה לינארית?

איזה קשר נוצר כדי להפוך את המולקולה לטבעתית?

Back 13

כאשר גלוקוז יהיה בתוך מים הוא יהיה טבעתי.

הקשר שנוצר הוא בין פחמן מספר 1 (פחמן אנומרי) לבין פחמן מספר 5 דרך החמצן (כך שהחמצן מהווה חלק מהטבעת).

Front 14

מה ההבל בין צורות אלפא ובטא של גלוקוז?

Back 14

אם ההידרוקסיל שנמצא על הפחמן האנומרי נמצא בקונפיגורציית cis להידרוקסיל בפחמן מספר 4 - צורת אלפא.

אם ההידרוקסיל שנמצא על הפחמן האנומרי נמצא בקונפיגורציית trans להידרוקסיל בפחמן מספר 4 - צורת בטא.

Front 15

מהו אפימר?

Back 15

סטריאואיזומר הנבדל מהמולקולות האחרות בקונפיגורציה שהינה בעלת מרכז גיראלי אחד בלבד אבל המולקולות שנוצרות אינן תמונות ראי אחת של השנייה.

Front 16

כיצד מאריכים ומקצרים שרשרת סוכרית?

Back 16

מאריכים על ידי תהליך הנקרא דחיסה (Condensation) שבמהלכו נפלטת מולקות מים.

מקצרים על ידי תהליך הנקרא הידרוליזה (Hydrolysis) שבמהלכו מוכנסת מולקולת מים.

Front 17

מהם שלושת תפקידי הליפידים?

Back 17

1. הליפידים מהווים את המרכיב העיקרי של הממברנות.

2. הליפידים משמשים כמקור אחסון לאנרגיה.

3. לליפידים יש תפקידים במעבר אותות.

Front 18

מה הנוסחא הבסיסית של ח. שומן?

Back 18

Front 19

מהם גליצרידים?

Back 19

הרכב הליפידים העיקרי בתאים ובממברנות - מולקולות בעלות ליבה של גליצרול שעליה נקשרות חומצות השומן.

הקשר הוא קשר אסטרי בין ההידרוקסיל של הגליצרול והקרבוקסיל של חומצת השומן.

Front 20

מה המבנה של גליצרופוספוליפידים?

Back 20

בתמונה ניתן לראות פוספוטידילכולין.

Front 21

מה ההבדל בין ליפוזום ומצילה?

Back 21

ליפוזום זהו מבנה בעל דו שכבה של פוספוליפידים עם ליבה הידרופילית.

מיצלה זוהי שכבה אחת של פוספוליפידים עם ליבה הידרופובית.

Front 22

מהו מבנה הDNA?

Back 22

הDNA בנוי בתור Double-Helix כאשר הוא מורכב משני חלקים מרכזיים:

1. הפוספט והסוכר - שיוצרים את עמוד השדרה הפוספו-סוכרי של הגדיל Phospho-sugar backbone, חלק הידרופילי הפונה כלפי המים.

2. בסיסים חנקניים - בין הבסיסים החנקיים יש קשרי מימן (או קשרי ווטסון וקריק).

Front 23

מהם שתי משפחות הנוקליאוטידים?

Back 23

פורינים - אדנין וגואנין

פירימידינים - ציטוזין, תימין ואורציל.

Front 24

Back 24

Adenine

Front 25

Back 25

Cytosine

Front 26

Back 26

Thymine

Front 27

Back 27

Uracil

Front 28

Back 28

Guanine

Front 29

מהם המושגים הבאים:

1. נוקליאוזיד

2. נוקליאוטיד

3. קשר פוספודיאסטרי

4. קשר N-Glycosidic

5. פורין

6. פירימידין

Back 29

1. נוקליאוזיד - בסיס + סוכר

2. נוקליאוטיד - בסיס + סוכר + פוספט

3. קשר פוספודיאסטרי - קשר בין ההידרוקסיל בקצב 3' על הסוכר לפוספט שבקצה 5' בסוכר הבא.

4. קשר N-Glycosidic - הקשר בין הבסיס החנקני והסוכר.

5. פורין - קשר N-Glycosidic בין פחמן 1 בסוכר וחנק 9 בבסס.

6. פירימידין - קשר N-Glycosidic בין פחמן 1 בסוכר וחנקן 1 בבסיס.

Front 30

מהם 3 סוגי הריאקציות בהן צריך להשקיע ATP?

Back 30

1. העברת דברים בין חוץ התא ותוכו בניגוד למפל הריכוזים.

2. תנועה, התכווצות שרירים.

3. סינטזה של מאקרומולקולות.

Front 31

מהם ארבעת המאפיינים של גדיל הDNA?

Back 31

1. Phospho-sugar backbone

2. זיווג בסיסים אנטי פרללי - קצה 5' פונה לקצה 3' ולהפך.

3. עמוד השדרה הפוספו-סוכרי פונה לתמיסה ובפני ישנם קשרי מימן בין הבסיסים החנקניים.

4. Template binding - כל גדיל של DNA נבנה על בסיס גדיל קודם.

Front 32

מהם המאפיינים של בנייה על פי תבנית בDNA?

Back 32

1. הוספה נקבעת לפי קצה 3'.

2. הזהות של הנוקליאוטיד שיכנס נקבעת לפי הזיווג המתאים על פי גדיל המקור.

3. הנוקליאוטיד הנכנס הוא dNTP.

Front 33

מהם ארבעת התכונות של RNA?

Back 33

1. גם הRNA היא חומצת גרעין המורכבת מנוקליאוטידים רבים.

2. לRNA יש בסיס חנקני אחד שונה מאשר לDNA - הבסיס אורציל (במקום תימין).

3. RNA יכול לשמש גם כקטליזטור - Ribozyme.

4. RNA פחות יציב מDNA.

Front 34

Back 34

Front 35

The main dogma

Back 35

Front 36

מהו המבנה הכללי של ח. האמינו?

Back 36

Front 37

מה זה Zewitterion?

Back 37

מצב בו לחומצה האמינית יש מטען חיובי בקצה אחד ובקצה השני מטען שלילי.

Front 38

כיצד RNA מקודד לחלבון?

Back 38

על ידי מולקולות הנקראות tRNA שיודעות לזהות את הקודונים השונים על מולקולת הRNA. חומצות האמינו מתחברות אחת לשניה בקשר פפטידי.

Front 39

מהו קודון?

Back 39

יחידה של שלושה נוקליאוטידים המקודד לחומצה אמינית.

לחומצה אמינית אחת יכולים להיות יותר מקודון אחד.

Front 40

tRNA - תאר את המבנה והתפקוד.

Back 40

על הtRNA ישנו איזור הנקרא Anti-codon הספציפי לחומצה אמינית, איזור אחר (קצה 3' עם רצף CCA) הוא האיזור שקושר חומצה אמינית.

הtRNA מזהה את הקודון הנמצא על מולקולת הmRNA בעזרת האנטי קודון שקיים עליו, אם יש התאמה הוא יתחבר לmRNA ויחבר את החומצה האמינית.

Front 41

איזה אנזים מתווך את חיבור החומצה האמינית לtRNA?

Back 41

tRNA synthetase.

Front 42

איך יכול להיות שיש 64 קודונים ורק 20 ח. אמינו?

Back 42

1. קודני STOP - ישנם 3 קודוני סיום. מה שאומר שישנם רק 61 קודונים של חומצות אמינו.

2. קודונים עודפים - למרבית חומצות האמינו יש יותר מקודון אחד שמקודד אותה חמצת אמינו.

Front 43

מאיזה כיוון נקראים הקודונים בRNA?

Back 43

מכיוון 5' ל-3'.

Front 44

מאיזה כיוון נקראות ח. האמינו בחלבונים?

Back 44

מכיוון ה-n-Treminus ל-c-Terminus.

Front 45

מה זה ORF?

Back 45

Open Reading Frame

זוהי מסגרת הקריאה. על כל מולקולות RNA ישנם 3 מסגרות קריאה אפשריות.

Front 46

מי קובע את הORF?

Back 46

קודון AUG שמשמש כקודון התחלה (וגם כקודון של החומצה האמינית מתיונין).

Front 47

מהם הקשרים הכימיים המעורבים בייצוב הקשרים בחלבונים?

Back 47

מבנה ראשוני - קשרים פפטידיים, קוולנטיים.

מבנה שניוני ושלישוני - קשרי מימן.

Front 48

מהם מבנים ראשוניים, שניוניים, שלישוניים ורבעונים בחלבונים?

Back 48

מבנה ראשוני - סדר חומצות האמינו בפפטיד.

מבנה שניוני - צורה תלת מימדית המתקבלת על ידי קשרים בין חומצות אמינו סמוכות (אלפא הליקס ובטא שיט).

מבנה שלישוני - קיפול מרחבי של החלבון.

מבנה רבעוני - קומפלקס של חלבונים היוצרים יחידה תפקודית אחת.

Front 49

מה חשיבות קשרי S-S?

Back 49

קשר החשוב מאוד לייצוב החלבונים. בקשר זה משתתפים שתי חומצות אמינו ציסטאין (Cys).

Front 50

איזה חומר ידוע כמחזר של קשרי S-S?

Back 50

Beta-Mercaptoethanol

Front 51

מהי רגולציה אלוסטרית?

Back 51

רגולציה הפועלת על שינוי מרחבי של האתר הפעיל בחלבון על ידי קשירת חומר רגולטורי באתר שהוא לא האתר הפעיל.

רגולציה אלוסטרית יכולה להיות מזרזת ויכולה להיות מדכאת.

Front 52

אילו חומצות אמינו ניתנות לזרחון?

Back 52

Serine (Ser), Threonine (Thr), Tyrosin (Tyr).

Front 53

כיצד נקרא חלבון המחובר לקבוצה פרוסטטית וכיצד נקרא חלבון שלא מחובר לקבוצה הפרוסטטית שלו?

Back 53

מחובר - Holoenzyme

לא מחובר - Apoenzyme

Front 54

מהם שלוש הצורות העיקריות לזירוז אנזימתי?

Back 54

1. קירוב חומרים בריאקציה.

2. שינוי סדר האלקטרונים בחומר מסוים.

3. שינוי צורני של הזוויות של הקשרים הכימיים.

Front 55

האם שתי שכבות הממברנה זהות?

Back 55

לא.

Front 56

הממברנה היא מחסום סלקטיבי. אילו חומרים יכולים לעבור אותה ולהיכנס לתא ואילו לא?

Back 56

מולקולות הידרופוביות קטנות - עוברות דרך הממברנה.

מולקולות קטנות, חסרות מטען אך פולאיות - עוברות דרך הממברנה.

מולקולות פולאריות גדולות ויונים - לא עוברות דרך הממברנה.

Front 57

איזה תזוזה מתאפשרת בממברנה?

Back 57

תזוזה לאטרלית, סיבוב על ציר - תזוזה באותה שכבה, ספונטנית.

פליפ פלופ - תזוזה משכבה אחת לשניה, לא ספונטנית, דורשת ATP ואנזימים (Flippase, Floppase, Scramblase).

סקרמבלאז לא צורך ATP אבל הוא דורש יוני סידן לפעולתו.

Front 58

כיצד מכניסים חומרים שלא יכולים לעבור את הממברנה?

Back 58

על ידי תעלות, משאבות ונשאים.

Front 59

לאן נשא פסיבי יעביר את החומר?

Back 59

על פי מפל ריכוזים.

Front 60

מהם שלושת הסוגים של נשא אקטיבי?

Back 60

1. הולכה מצומדת (Couple transporter) - הולכה של מולקולות נגד מפל ריכוזים בצימוד למולקולה אחרת שתעבור עם מפל הריכוזים.

2. הולכה במשאבות מופעלות ATP.

3. הולכה במשאבות מופעלות באור.

Front 61

מה זה אוסמוזה?

Back 61

מעבר של מולקולות מים מריכוז מומסים נמוך לריכוז מומסים גבוה.

Front 62

מהם שלושת הסוגים של הולכה מצומדת?

Back 62

1. Uniport - הולכה של חומר אחד עם מפל הריכוזים - הולכה פאסיבית.

2. Symport - הולכה של חומר אחד עם מפל הריכוזים וחומר שני נגד מפל הריכוזים אך באותו כיוון.

3. Antiport - הולכה של חומר אחד עם מפל הריכוזים וחומר שני נגד מפל הריכוזים בכיוונים שונים.

Front 63

תאר את רך הפעולה של משאבות נתרן אשלגן.

Back 63

משאבה מסוג Antiport, בעת איזור אנזימטי הנקרא ATPase המפרק ATP ונותן את האנרגיה לתהליך. משאבה זו מעבירה את שני החומרים כנגד מפל הריכוזים שלהם. המשאבה מעבירה שלוש מולקולות נתרן אל מחוץ לתא ושתי מולקולות אשלגן אל תוך התא.

Front 64

מה מטען הממברנה (חיובי/שלילי) במצב רגיל?

Back 64

הצד הפני של הממברנה (בצד הציטוזולי) יהיה בעלת מטען שלילי ואילו הצד החיצוני של הממברנה יהיה בעל מטען שלילי.

Front 65

מה זה דה-פולירזציה?

Back 65

צמצום הפרש המטענים בין הצד החיצוני של הממברנה לצד הפנימי. דבר זה מאפשר העברת אותו נוירולוגיים.

Front 66

מהו המבנה של תא עצב?

Back 66

Front 67

ממה מורכב המיאלין העוטף את האקסון?

Back 67

מתאי Shwan שעוטפים את האקסון עם הממברנה שלהם. על הממברנה שלהם יש הרבה ספינגוליפידים מסוג Sphingomyelin.

Front 68

כיצד עוברים מסרים עצביים?

Back 68

כאשר מגיע סיגנל אל הדנדריט תעלות הנתרן נפתחות וגורמות לדה-פולריזציה באיזור הדנדריט, זהו האות החשמלי. המטען לא נשאר בגוף התא אלא עובר לאורך האקסון עד לסינפסה עד לתא המטרה.

Front 69

מה החשיבות למידור הגרעין?

Back 69

הגנה על החומר התורשתי, ביצוע עיבודים שונים למולקולת הmRNA לפני שהיא עוברת את תהליך התרגום.

Front 70

ממה מורכבת מעטפת הגרעין?

Back 70

מורכב משתי ממברנות דו שכבתיות (Inner/Outer nuclea membrane) שהיא המשך ישיר של הER. ישנה רשת המצפה את ממברנת הגרעין מבפנים הנקראית Nuclear lamina והיא זו שמקנה חוזר מבני לגרעין.

Front 71

מהו כרומטין?

Back 71

קומפלקס של DNA וחלבונים.

יש שני סוגים של כרומטין;

1. אאוכרומטין - הצורה הפתוחה בה יכול להתבצע שעתוק.

2. הטרוכרומטין - הצורה הסגורה בה לא יכול להתבצע שעתוק.

Front 72

מה קורה בגרעינון?

Back 72

שיעתוק של rRNA.

Front 73

דרך איפה נכנסים ויוצאים חומרים לגרעין?

האם יש הגבלת משקל?

Back 73

החומרים יוצאים ונכסים דרך שערים הנקראים Nuclear pores. כן ישנה הגבלת משקל של 40kDa.

Front 74

תאר את מבנה הNuclear pores.

Back 74

Front 75

מהו רצף NLS?

Back 75

Nuclear localization signal.

רצף שמוזהה על יד רצפטור האחראי על הכניסה של החלבון לגרעין. הרצף הוא:

Pro-Pro-Lys-Lys-Lys-Arg-Lys-Val

Front 76

איך חלבונים שגדולים מ-40kDa נכנסים לגרעין?

Back 76

חלבון בעל רצף NLS מזוהה על ידי רצפטור של טרנספורטר. הטרנספורטר מזוהה על ידי הפיברילות של הפורה בגרעין והפורה נפתחת ונותנת לקומפלקס חלבון-רצפטור להיכנס אל הגרעין.

כדי לשחרר את החלבון מגיע Ran-GTP ומתחבר אל הרצפטור תוך שהוא מוציא את החלבון.

הקומפלקס רצפטור-Ran-GTP יוצא מהגרעין, הGTP עובר הידרוליזה לGDP וRan-GDP לא יכול להיקשר יותר אל הרצפטור. הרצפטור פנוי לקבלת חלבון נוסף.

כדי להחליף את הGDP בGTP מגיע חלבון GEF - Guanine exchainge factor שנמצא בגרעין.

כדי לבצע הידרוליזה לGDP מגיע GAP - Guanine activation factor.

Front 77

מהו נוקליאוזום?

Back 77

הנוקליאוזום מורכב מכ-200 זוגות בסיסים (bp) שמתוכם 147bp מלופפים סביב אוקטמר של היסטונים ועוד כ-50bp הנקראים Linker DNA המחבר בין אוקטמר אחד לשני.

Front 78

מהם היסטונים?

Back 78

היסטונים אלו חלבונים שיוצרים אוקטמר שעליו מתלפף הDNA. להיסטונים אלו יש ריכוז גבוה יחסית של חומצות אמינו חיוביות על מנת שיוכלו לקשור את הDNA בצורה טובה יותר. ישנם ארבעה היסטונים שונים המרכיבים את האוקטמר במצב רגיל (2 מכל אחד):

H2A, H2B, H3, H4

Front 79

מהם Chromatin remodeling complexes?

Back 79

קומפלקסים של חלבונים המסוגלים להסיע את הDNA מסביב לוקטמר וכך להזיז נוקליאוזומים.

בעזרת חלבונים נוספים (צ'פרונים של היסטונים) הם יכולים להוציא את האוקטמר של ההיסטונים ולהחליפו באוקטמר אחר.

Front 80

מה תפקידו של היסטון H1?

Back 80

הוא קושר את הCore particle וגם את הLinker ומקטין את הזווית בינהם מה שמאפשר לדחוס יותר טוב את הנוקלאוזומים.

Front 81

מהי דרגת הדחיסה המקסימלית של הDNA?

Back 81

כרומוזום.

Front 82

מהם שלוש המודיפיקציות האפשריות להיסטון?

Back 82

1. אצטילציה - הוספת אצטיל על השייר החיובי של ליזין, גורם לפחות מטען חיובי ולפחות משיכה של הDNA אל האוקטמר - גורם לשחרור של הDNA.

2. מתילציה - מגיל את המטען החיובי ומעלה את רמת הדחיסות של הDNA.

3. פוספורלציה - הוספת פוספט על השייר של סרין, כתוצאה מכך רמת הדחיסות יורדת.

Front 83

מהם שלושת המאפיינים שחייבים להיות לכרומוזום?

Back 83

1. Replication origin (Ori)

2. Telomere

3. Centromere

Front 84

נהוג לחלק את מחזור התא לשתי חלקים; מהם?

Back 84

1. Interphase - Includes G1/S/G2 - phase

2. Mitosis

Front 85

מהם תנאי הסביב הצריכים להתקיים כדי שהתא ייכנס לחלוקה?

Back 85

1. שיהיה מספיר מזון כדי לקיים את שתי התאים.

2. הפרשת פקטורי גדילה לסביבה בה התא מתקיים.

3. טמפרטורה, pH, אור במידה המתאימה לגדילה תאית.

Front 86

מהם שלבי האינטרפאזה?

Back 86

G1/0 phase

S phase

G2 phase

Front 87

מהם שלושת הCheckpoints?

Back 87

1. נקודת הבקרה הראשונה נקראת גם הRestriction point מכיוון שאחרי נקודה זו התא חייב להמשיך עד סוף המיטוזה. היא נמצאת בסוף G1 ושם התא בודק האם התנאים מעודדים חלוקה.

2. נקודה הבקרה השניה היא בין G2 למיטוזה ונקראת G2/M checkpoin. בנקודה זו התא בודק האם כל הDNA הוכפל כמו שצריך והאם עדיין הסביבה מעודדת חלוקה.

3. נקודת הבקרה השניה היא בין שלב המטהפאזה לשלב האנאפאזה והיא נקראת Metaphase-to-anaphase checkpoint. בנקודה זו התא בודק האם כל הכרומוזומים מסודרים על הכישור.

Front 88

מה זה MPF?

Back 88

M-Phase promoting factor

Front 89

מה ההבדל בין אפופטוזיס לנקרוזיס?

Back 89

אפופטוזיס הוא מוות תאי מתוכנן בעוד שנקרוזיס הוא מוות תאי כתוצאה מטראומה לתא.

Front 90

מהן קספאזות ומתי הן נמצאות בתא?

Back 90

קספאזות הן פרוטאזות האחראיות על ביצוע אפופטוזיס. הן נמצאות תמיד בתא אך במצב בלתי פעיל.

Front 91

כיצד מפעילים קספאזות?

Back 91

על ידי חיתוך של הקצה האמיני והקרבוקסילי ואיחוד של שני קספאזות לדימר פעיל.

Front 92

כמה נקבל בGRE?

Back 92

אם הגעתם עד לפה אז לפחות 720