• Shuffle
    Toggle On
    Toggle Off
  • Alphabetize
    Toggle On
    Toggle Off
  • Front First
    Toggle On
    Toggle Off
  • Both Sides
    Toggle On
    Toggle Off
  • Read
    Toggle On
    Toggle Off
Reading...
Front

Card Range To Study

through

image

Play button

image

Play button

image

Progress

1/18

Click to flip

Use LEFT and RIGHT arrow keys to navigate between flashcards;

Use UP and DOWN arrow keys to flip the card;

H to show hint;

A reads text to speech;

18 Cards in this Set

  • Front
  • Back

Hvad er DNA markørere?

DNA seksvenser som optræder hyppigt i en given befolkning.



Man kan bruge dem til at skelne mellem homologe kromosomer.

Hvilke typer af DNA markørere er der?

- Single nucleotide polymorphism (SNP), enkelt-nukleotid-polymorfisme


- Microsatellitmarkører


- Variable number of tandem repeats (VNTR)


- Restriktions-fragment-længde-polymorfi (RFLP)

A. Det fulde navn for SNP?



B. Hvad er det?

A. Single nucleotide polymorphism = enkelt-nukleotid-polymorfisme



B. Variation i et enkelt basepar.



Eksempel:


Sekvensen ATTCCG kan være alment udbredt i populationen, mens den hos visse individer er ændret til AATCCG.



Forekommer i både kodende og ikke kodende områder i genomet.



Betydning i kodende områder:


--> Evt ændring i aminosyresekvensen/rækkefølgen af aminosyrerne i det producerede protein.



Betydning i ikke-kodende områder:


--> EVt for genets splejsning eller binding af transkriptionsfaktorer.

A. Det fulde navn for VNTR?



B. Hvad er det?



C. Hvad kalder man dem også?



D. Længde i forhold til microsatelliterne?

A. Variable number of tandem repeats



B.


- Gentagne sekvenser i menneskets genom


- Varierer fra person til person.


- Kan undersøges ved gel-elektroforese.



C. Minisatelliter



D. Længere end microsatelliter

A. Hvad er microsatellitmarkørere?



B. Længde i forhold til minisatelliter?

A.


- Gentagne sekvenser i menneskets genop


- Varierer fra person til person


- Kan undersøges ved gel-elektroforese



B. Kortere end minisatelliter


.

RFLP?

Restriktions-fragment-længde-polymorfi



En normal variation (ofte basesubstitution) i DNA-sekvenser på homologe kromosomer.



Resulterer i restriktionsfragmenter af forskellige længder ved kløvning med restriktionsenzymer.



Resrtriktionsfragmenternes længder kan undersøges i gel-elektroforese.

Repetetivt DNA?

Kan være:


Microsatalliter (SNPs)


- Små sekvenser, der gentages mange gang i genomet



Minisatalliter (VNTPs)


- Længere sekvenser der gentages mange steder i genomet.

cDNA syntese ?


Hvilke fordel er der ved brug af en cDNA?

cDNA = complementary DNA



- Syntetiseres udfra det mature mRNA.



- Ved at bruge cDNA i stedet for gDNA, kan man undersøge det funktionelle, færdigproducerede mRNA. Det bliver dermed muligt at studere posttranskriptionelle modifikationer, såsom splejsning.

Plasmid

Lille, cirkulær, selv-replikerende stykke af DNA i bakterier

Probe


A. Hvad er det?


B. Hvor bruges denne?

A.


- Kort, enkeltstrenget stykke DNA mærket radioaktivt eller med fluorescens farvestof


- Komplementært til et specifikt område i genomet.



B.


- Southern Blot


- Fish


- In situ hybridisering


- SKY

Primer



A. Hvad er det?


B. Hvor bruges det?

- Kort, enkeltstrenget stykke DNA eller RNA,


- Fungerer som begyndelsessekvens for dannelsen af en ny DNA- eller RNA-streng.



Bruges i forbindelse med:


- DNA sekventering


- PCR


Hvad er Oligonukleotid?

Kort kæde af nukleotider (deoxy-eller ribonukleotider), der er koblet sammen på samme måde som i cellens DNA og RNA.



Eksempler:


- Primer


- Prober


Denaturering?

DNA-strengene gøres enkeltstrengede



Det tredimensionelle struktur af DNA'et ødelægges under forhøjet temperatur ved brydning af hydrogenbindinger, der holder de to strenge sammen.

Annealing?

Når primerne binder til de komplementære sekvenser i DNA'et

Revers transskriptase?

Ensym, der fremmer dannelsen af DNA ud fra RNA streng.



Betegnelsen revers skyldes, at enzymet virker i modsat retning af den normale informationsstrøm i cellen: fra DNA til RNA.

A.


Hvorfor er CGH array på de fleste måder bedre end klassisk CGH?



B.


Hvor kan CGH array ikke bruges i modsætning til det klassiske CGH?

A.


- Bedre opløselighed


- Meget automatiseret


- Ingen behov for levende celler (metafasekromosomer)


- Brug for mindre mængde af DNA fra test person.



B.


Kan ikke bruges ved detektering af balancerede translokationer.

Hvilke markører har hhv få og mange alleler?

Markører med få mulige alleler:


- SNP


- RFLP



Markører med mange mulige alleler


- VNTR

Hvornår forekommer der ikke overkrydsning mellem markørlocus og sygdomslocus og hvornår gør der?

Forkekommer ikke hvis makørlocus ligger intragenetisk - dvs. markørlocus er fuldstændigt koblet til sygdomslocus - 0 cM.



Forekommer hvis markørlocus ligger ekstragenetisk - dvs. markørlocus er ikke fuldstændigt koblet til sygdomslocus - genetisk afstand forekommer på cM