Use LEFT and RIGHT arrow keys to navigate between flashcards;
Use UP and DOWN arrow keys to flip the card;
H to show hint;
A reads text to speech;
18 Cards in this Set
- Front
- Back
|
Vad innebär synonym och icke-synonym ersättning av en nukleotid? |
Synonym: Är en ersättning som ej ändrar den kodande AS. Påverkar ej proteinfunktionen. Bidrar ofta inte till naturlig selektion. Ofta skadliga för organismen, men om fördelaktig resulterar det ofta i positiv selektion. Alla ändringar förändrar ej proteinets form/funktion, vissa kan vara neutrala. Icke-synonym: ersättning som ändrar AS-sekvensen i en kodande gen |
|
|
Varför är mutationshastigheten oberoende av populationsstorleken? |
Då en mutation är troligare att dyka upp i en stor population är chansen för fixering betydligt lägre. Tvärt om gäller för små populationer |
|
|
Vad är konvergent evolution? |
Olika arter som ej är nära släkt men utvecklat samma egenskaper oberoende av varandra. ex: vingar och lysozym |
|
|
Vilka är de två formerna av homologi? |
Paralog: gener i samma eller olika arter som är släkt via duplikationshändelser Ortologer: Gener funna i olika arter och vilkas skillnad kan spåras till artbildning. |
|
|
Vad innebär Exon Shuffling-teorin? |
Primitiva exoner matchar med funktionella moduler. Duplications, permutations (change place) & rearrangements of these exons results in novel genes with diverse functional modules. Used to explain the advantage of exon-intron split |
|
|
Molekylära klockan, förklara vad den används till? |
Används för skattning av hur lång tid två arter varit separerade. Hastigheten är oberoende av pop.strl. Så länge mutationshast. är konstant sker neutrala mutationer i konstant takt oberoende av pop.strl. |
|
|
Cytokrom C |
Bra för att skatta ålder till gemensam anfader. Proteinsekvens som avgör arters olika ursprung eftersom arvet är mekanismen som för vidare genen. |
|
|
Polyploidi hos fiskar |
Fiskars genom fördubblades (tetraploit). Diversiteten ökar eftersom det fanns fler gener. Många gener förloras. Vissa gener gav nya funktioner, ex. voltage-gated Na-kanaler i elektrisk fisk eller neonfunktion hos sebrafisk. |
|
|
Sequence alignment to compare proteins & genes Similarity Matrix |
Jämför två homologa AS-sekvenser Sätt in "gaps" för att se var evolutionära deletioner eller inserts av AS skett. Jmf sekvenserna genom att räkna nukleotider/AS som skiljer dem åt. Skapa en Similarity Matrix genom att sammanfatta likheter/skillnader. övre diagonalen = antal olikheter undre diagonal = antal likheter |
|
|
"Neutrala teorin" ang. neutrala mutationer |
Varianter som vi obs. i de flesta pop. är neutrala substitutioner, ger varken för eller nackdelar. Utvecklas mer genom genetisk drift än pos. selektion. Antalet fixerade neutrala mutationer som sker genom genetisk drift är oberoende av pop. storlek. Så länge mutationshast. är konstant så ändras neutrala ändringar i en konstant takt (mol. klockan) |
|
|
Stort genom inte alltid mer komplext än ett mindre. |
Stort genom kan sakta ner utvecklingshast. Strl. på genom kan ge antydan på hur effektivt det tar bor junk-DNA (transposoner osv.) I små pop kan genetisk drift överrumpla selektionen mot junk-DNA etc. |
|
|
Ex. på horisontell genöverföring från vertebrat till fästingar (kärlvidgande hormon - ADM -> TAM). |
Fästingar är ekoparasiter som injicerar bioaktiva mol när de tar in föda för att minska värdförsvar. Hur? Kanske såhär... Tick ingest blood from host DNA from red blood cells diffuse in body cavity DNA reaches egg & ADM encoding gene becomes accidentally integrated into tick genome. Selection favored ticks carrying ADM which mutated & evolved into todays TAM. |
|
|
Transposons & the adaptive immune system Genomet är begränsat, hur kan vi göra så många antikroppar? |
Transposoner (ofta) dåligt för genomet, rör om genomet, men ibland händer bra saker. B- & T-lymfocyter prod. mängder av antikroppar och T-cellsreceptorer. |
|
|
Ortholog Paralog |
O: Genes found in different species who's divergence can be traced to a speciation event, a common ancestor. P: Genes in the same or diff. species that are related through duplication events. |
|
|
Experimental Evolution |
The evolution of genomes can be studied experimentally. Diverse environment allow "rapid" evolution of diverse phenotypes (genotypes). |
|
|
Genomes can evolve through a variety of mechanisms. One such mechanism is the acquisition of novel genes via horizontal genes via horizontal gene transfer (HGT). Please explain what HGT actually means och describe a specific example of its occurance and consequence in a multicellular organism.
|
HGT means transfer of genes between organisms/species. Not mothercell to daughter cell. Ex. Tick that sucks blood from one species which red blood cell genes gets transfered to the tick via HGT. A gene that is favorable for the tick and will therefore stay within the species as it makes it a fitter species. (fick full pott för detta svar) |
|
|
Describe how a transposon has likely contributed to the evolution of the complex genes that encode antibodies in vertebrates, only explain the likely origin of the complex loci, not how they are today expressed to generate antibody diversity. |
Transposoner och det adaptiva immunförsvaret. |
|
|
What great genetic event took place abt 350 million yrs ago and likely contributed to the species explosion in teleost fish? Why did that genetic event facilitate the evolution if novel species? |
Polyploidi hos fiskar, genom fördubblades vilket ökade diversiteten pga fler gener. Många gener förloras, några gener gav nya funktioner. Ex. voltage-gated Na-kanaler hos elfisk eller neonfunktion hos zebrafisk. |
